Aprosoff,Dyakov_2022_SLX4_BioID 数据集
该数据集包含 18 个原始 MS 文件及相关的峰列表和结果文件,由 TripleTOF 6600 质谱仪以数据依赖采集模式获取

基本信息
资源简介
Aprosoff,Dyakov_2022_SLX4_BioID 数据集
该数据集包含 18 个原始 MS 文件及相关的峰列表和结果文件,由 TripleTOF 6600 质谱仪以数据依赖采集模式获取。样本由 Camila Aprosoff 和 Vivian Chung 制备,链霉亲和素亲和纯化、质谱采集和数据分析由 Boris Dyakov 完成。数据与 Aprosoff 等人提交的论文相关,该论文利用 BioID 鉴定与 SLX4 相关的蛋白质。数据集可用于研究 SLX4 相互作用蛋白及范可尼贫血相关机制(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含 18 个原始 MS 文件及相关的峰列表和结果文件,由 TripleTOF 6600 质谱仪以数据依赖采集模式获取。样本由 Camila Aprosoff 和 Vivian Chung 制备。链霉亲和素亲和纯化、质谱采集和数据分析由 Boris Dyakov 完成。这些文件与 Aprosoff 等人提交的论文相关,该论文利用 BioID 鉴定与 SLX4 相关的蛋白质。该论文中包含的 AP-MS 数据集由 Cassandra Wong(Gingras 实验室)单独上传至 MassIVE。Haley Wyatt 是论文的通讯作者(haley.wyatt@utoronto.ca)。有关该数据集的问题应联系 Anne-Claude Gingras(gingras@lunenfeld.ca)。
【主题与分类】
主题标签:Proteomics。本站分类:血液与淋巴系统疾病/范可尼贫血。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000090338
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000090338
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含18个原始质谱文件及相关的峰列表和结果文件,这些数据是在TripleTOF 6600质谱仪上以数据依赖采集模式获取的。样本由Camila Aprosoff和Vivian Chung制备。链霉亲和素亲和纯化、质谱数据采集及数据分析由Boris Dyakov完成。这些文件与Aprosoff等人提交发表的手稿相关,该手稿利用BioID技术鉴定了与SLX4相关的蛋白质。手稿中包含的AP-MS数据集已由Cassandra Wong(Gingras实验室)单独上传至MassIVE。Haley Wyatt是手稿的通讯作者(haley.wyatt@utoronto.ca)。关于此数据集的问题,请联系Anne-Claude Gingras(gingras@lunenfeld.ca)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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