骨髓增殖性疾病临床测序数据集
本数据集专注于骨髓增殖性疾病患者的CD34+造血干祖细胞表达谱,涵盖了原发性血小板增多症等多种亚型。通过对造血干细胞层面的基因表达分析,该数据集为研究骨髓异常增生的起源、克隆演化过程提供了宝贵的实验证据,是理解ET发病机理的重要参考资源。

基本信息
资源简介
骨髓增殖性疾病临床测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Expression data from patients with Essentiel Thrombocythemia (ET), Polycythemia Vera (PV), Primary Myelofibrosis (PMF) and control subjects》。源站首次发布:Dec 14 201。
【数据内容】
源站原始描述:We used microarrays to assess gene expression in patients with ET, PV, and PMF compared to control subjects
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE26049
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 27 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE26049
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含原发性血小板增多症及其他MPN患者的CD34+细胞基因表达数据,支持对造血干细胞层面的疾病研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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