CMML 全外显子组测序样本数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了 106 例慢性粒单核细胞白血病(CMML)样本的全外显子组测序(WXS)数据,并提供双端 fastq 文件

omicsdi
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基因组分类Genomics
a21f9dff-b035-4b35-93ce-27a4a467822b - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

CMML 全外显子组测序样本数据集

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了 106 例慢性粒单核细胞白血病(CMML)样本的全外显子组测序(WXS)数据,并提供双端 fastq 文件。慢性粒单核细胞白血病属于血液与淋巴系统疾病范畴,全外显子组测序则是一种聚焦于基因组蛋白编码区域的高通量测序策略,常用于识别与疾病相关的编码区变异。本数据集以样本为单位组织,主题标签为 Genomics,可为 CMML 相关的基因组学研究提供原始测序数据基础。

【数据集背景】

慢性粒单核细胞白血病(CMML)是一类同时具有骨髓增生异常和骨髓增殖特征的血液系统疾病,归属于血液与淋巴系统疾病。对该类疾病开展全外显子组测序,有助于从编码区层面观察样本的基因组特征。本数据集正是在这一背景下,由 omicsdi.org 收录,聚焦 CMML 样本的外显子组测序数据,主题标签为 Genomics。

【数据内容】

数据集包含 106 例 CMML 样本的全外显子组测序(WXS)数据。测序数据以双端 fastq 文件形式提供,即每条序列读段由成对的 fastq 文件承载。数据集英文名为 a21f9dff-b035-4b35-93ce-27a4a467822b - samples。除上述内容外,源站未提供关于样本临床信息、测序平台、读长、覆盖度、文件数量与体积等更细粒度的说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出,这是 106 例 CMML 样本的全外显子组测序数据,并提供双端 fastq 文件。关于样本的具体采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序机构及建库方法等,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可用于 CMML 相关的基因组学分析场景,例如对全外显子组测序数据进行变异识别、编码区变异注释与比较分析等。由于提供的是双端 fastq 原始读段文件,使用者可将其作为上游输入,开展比对、变异检测等常规外显子组数据处理流程。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否适用于其他特定分析目的,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据双端 fastq 文件的组织形式,将成对读段分别作为双端测序的两端输入,进入标准的外显子组分析流程。具体流程步骤、推荐工具与参数设置,源站未提供。数据集的下载方式、访问地址与文件组织细节,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、测序深度、覆盖均一性、污染情况或批次效应的评估信息。数据集仅包含 106 例 CMML 样本,未提供对照组或其他疾病类型样本的说明。关于数据是否存在使用限制、是否经过质控过滤等,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001007026

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

106 Whole Exom Sequencing (WXS) of CMML samples. Paired-end fastq are provided.

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