慢性髓系白血病65例患者样本WES与RNA-Seq数据集

该数据集来自omicsdi.org,包含65例慢性髓系白血病(CML)患者在不同疾病进展阶段的WES与RNA-Seq fastq文件,主题标签为Genomics

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-sacgf-27-06-2018-08:51:31:905-1336 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

慢性髓系白血病65例患者样本WES与RNA-Seq数据集

该数据集收录了65例慢性髓系白血病(CML)患者在不同疾病进展阶段的WES与RNA-Seq fastq文件,主题标签为Genomics,来源于omicsdi.org,本站归类于血液与淋巴系统疾病下的慢性髓系白血病方向。从数据构成来看,它同时覆盖了全外显子组测序与转录组测序两类高通量测序数据,样本对应疾病进展的多个阶段,因此可用于观察CML在基因组与转录组层面的变化特征。整体而言,该数据集以测序原始读段文件为核心内容,面向白血病基因组学研究场景,适合作为探索CML疾病进展分子机制的原始数据资源。

【数据集背景】

慢性髓系白血病是一种与血液及淋巴系统相关的疾病,其疾病进展过程涉及分子层面的变化。该数据集聚焦于CML患者样本,覆盖不同疾病进展阶段,主题标签为Genomics,说明其定位在基因组学分析方向。数据集来源于omicsdi.org,本站将其归入血液与淋巴系统疾病 / 慢性髓系白血病分类。关于该数据集的具体研究背景、立项目的、所属项目或论文出处,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含65例CML患者样本的WES与RNA-Seq fastq文件。WES即全外显子组测序,RNA-Seq即转录组测序,二者均以fastq格式提供,属于测序原始读段数据。样本数量为65例,且这些样本对应疾病的不同进展阶段。除上述内容外,关于每个样本的具体临床信息、测序深度、读长、文件数量与体积、参考基因组版本等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自omicsdi.org。源站描述表明其内容为65例CML患者样本在不同疾病进展阶段的WES与RNA-Seq fastq文件。关于样本采集机构、采集时间、采集地点、测序平台、建库方法及具体处理流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其包含WES与RNA-Seq两类数据,并覆盖CML不同疾病进展阶段,该数据集可用于基因组学与转录组学方向的分析场景,例如考察不同进展阶段样本在编码区变异与基因表达层面的特征。主题标签为Genomics,也表明其适用于基因组学相关研究。关于该数据集在具体研究中的验证结论或推荐应用范围,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以fastq文件形式提供WES与RNA-Seq数据,使用者可按常规高通量测序数据处理流程对fastq文件进行后续分析。关于是否提供配套的分析流程、质控标准、比对与定量建议、数据下载方式及访问入口,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含65例CML患者样本,覆盖不同疾病进展阶段,并提供WES与RNA-Seq两类fastq文件。关于数据质量评分、污染情况、批次效应、样本排除标准及使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及署名要求,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004179

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含65例处于不同疾病进展阶段的CML患者样本的WES和RNA-Seq fastq文件。

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