脾切除术后非编码RNome研究(队列A)

该数据集来自NCBI GEO,标题为脾切除术后非编码RNome研究(队列A),属于血液与淋巴系统疾病/出血性疾病分类。研究通过ncRNA全基因组芯片分析循环外周血白细胞的非编码RNome,包含1个文件(GSE133588_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及非编码RNA谱分析、G

geo
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基因组Non-coding RNA profiling by arrayGPL228589606
GSE133588: The non-coding RNome after splenectomy (cohort A)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

脾切除术后非编码RNome研究(队列A)

GSE133588(队列A)是一项聚焦脾切除术后非编码RNome的研究数据集,来源于NCBI GEO,归入血液与淋巴系统疾病/出血性疾病分类。该研究以循环外周血白细胞为对象,通过ncRNA全基因组芯片开展非编码RNA谱分析,旨在刻画脾切除后外周血白细胞中非编码RNA的表达格局。数据集由George A. Calin提交,主题标签涵盖非编码RNA谱分析、GPL22858平台与9606物种信息,共包含1个数据文件,即GSE133588_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集为研究脾切除这一干预条件下循环白细胞非编码RNA变化提供了可下载的芯片表达矩阵资源,适合在血液与淋巴系统疾病背景下开展非编码RNA层面的探索性分析。

【数据集背景】

该数据集标题为“The non-coding RNome after splenectomy (cohort A)”,即脾切除术后非编码RNome研究(队列A)。源站描述指出,研究者通过开展ncRNA全基因组研究,探索循环外周血白细胞的非编码(nc)RNome。数据集被本站归入血液与淋巴系统疾病/出血性疾病分类,主题标签包括“Non-coding RNA profiling by array”、GPL22858与9606,表明其研究对象为人源样本,采用芯片方法进行非编码RNA表达谱分析。作者为George A. Calin,发布时间为Jul 01 201。

【数据内容】

数据集包含1个文件,文件样例为GSE133588_series_matrix.txt.gz,即系列矩阵文件,以GZIP压缩包形式提供。该文件对应非编码RNA芯片表达谱的矩阵化整理结果。主题标签中的GPL22858指向所使用的芯片平台,9606指向人类物种。源站未提供矩阵中具体样本数量、探针数量、表达值类型及分组注释等细节。

【采集与来源】

数据来源于ncbi.nlm.nih.gov。源站描述说明,研究对循环外周血白细胞进行非编码RNA全基因组研究,以获取其ncRNome信息。样本类型为循环外周血白细胞,研究设计涉及脾切除术后状态(队列A)。作者为George A. Calin。源站未提供具体的样本采集时间、地点、伦理审批信息及队列划分标准的详细说明。

【适用场景】

该数据集适用于血液与淋巴系统疾病/出血性疾病背景下非编码RNA表达谱的探索性研究,例如比较脾切除术后循环外周血白细胞中非编码RNA的表达格局、筛选候选非编码RNA标志物,或作为非编码RNA芯片研究的参考数据。主题标签表明其属于非编码RNA谱分析的芯片研究,可用于方法学比较与数据整合分析。源站未提供具体的分析结论或验证结果。

【使用方法】

使用时可下载数据文件GSE133588_series_matrix.txt.gz,按GZIP压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于文件为系列矩阵形式,读取后应检查行列表头、样本标识与表达值编码方式,确保解析正确。源站未提供配套的分析脚本、注释文件或标准化流程说明。

【质量与限制】

数据集仅包含1个系列矩阵文件,源站未提供原始芯片图像文件、样本元数据表或质控报告,因此无法从现有信息评估数据质量、批次效应或标准化程度。源站未提供样本量、重复设计及统计功效等信息。使用时应注意该数据集为队列A,源站未说明其与其他队列的关系。所有未在源站描述中出现的指标与结论均不适用于本数据集。

【引用与许可】

作者为George A. Calin,来源站为ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名为GSE133588: The non-coding RNome after splenectomy (cohort A)。源站未提供具体的引用文献、DOI、许可条款或使用限制说明,使用前应向源站核实相关引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE133588

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

We explored the non-coding (nc)RNome of circulating peripheral blood leukocytes by performing a ncRNA genome wide study

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