BRIDGE联盟出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异样本全外显子测序BAM文件数据集

该数据集来自omicsdi.org,收录BRIDGE Consortium中携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异样本的全外显子测序BAM文件

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-UCAM-GEL-15-04-2015-15:15:23:555-345 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

BRIDGE联盟出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异样本全外显子测序BAM文件数据集

该数据集英文名为 ena-DATASET-UCAM-GEL-15-04-2015-15:15:23:555-345 - samples,来源于 omicsdi.org,归类于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病方向,主题标签为 Genomics。其核心内容为 BRIDGE Consortium 中携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异样本的全外显子测序 BAM 文件。整体来看,该数据集面向出血与血小板相关遗传性疾病的研究,提供以全外显子测序比对结果形式保存的样本数据,适合用于变异复核、基因层面关联分析以及相关疾病分子机制探索等场景。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

出血性疾病与血小板疾病涉及多种遗传因素,部分病例与特定基因上的致病或可能致病变异相关。针对这类疾病,采用全外显子测序有助于在蛋白编码区域范围内发现与疾病表型相关的变异。该数据集来自 BRIDGE Consortium,聚焦于携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异的样本,并以全外显子测序 BAM 文件的形式组织,为相关遗传学研究提供数据基础。其分类位于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病,主题标签为 Genomics,说明其应用方向主要集中在基因组学与血液系统疾病交叉领域。

【数据内容】

该数据集收录的是全外显子测序 BAM 文件,样本来自 BRIDGE Consortium 中携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异的个体。BAM 文件通常用于存储测序 reads 与参考序列比对后的结果,可用于后续变异查看、比对质量评估及相关分析。数据集名称中包含“samples”字样,表明其以样本为单位进行组织。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、具体基因列表、变异位点、测序平台、覆盖深度、读长等更细粒度的说明。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org,数据集英文名称为 ena-DATASET-UCAM-GEL-15-04-2015-15:15:23:555-345 - samples。源站描述指出,这些是全外显子测序 BAM 文件,对应 BRIDGE Consortium 中携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异的样本。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体机构参与情况以及数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于出血性疾病和血小板疾病相关的遗传学研究,尤其是围绕致病或可能致病变异开展的基因层面分析。全外显子测序 BAM 文件可用于重新比对、变异识别复核、比对结果可视化以及候选变异筛选等任务。对于关注血液与淋巴系统疾病,特别是出血性疾病的研究者,该数据集可作为样本层面的测序数据资源,用于探索相关基因变异与疾病之间的关联。主题标签 Genomics 也表明其适合基因组学方向的分析工作。关于更具体的应用案例或验证结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以全外显子测序 BAM 文件形式提供,使用者通常需要借助支持 BAM 格式的基因组学分析工具进行读取、比对结果查看和变异分析。由于数据来自携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异的样本,使用时可结合相关基因 panel 或全外显子分析流程进行筛选与验证。关于下载方式、文件组织目录、参考基因组版本、配套注释文件以及推荐分析流程等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集聚焦于 BRIDGE Consortium 中携带出血或血小板疾病相关基因致病或可能致病变异的样本,并以全外显子测序 BAM 文件呈现。其局限在于,源站未提供样本量、测序质量指标、覆盖度、变异验证状态、对照设置以及数据完整性说明。因此,在使用时无法仅凭现有信息判断数据质量高低或是否满足特定分析要求。此外,关于数据是否经过额外过滤、是否包含临床表型详细信息、是否可直接用于临床诊断等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 omicsdi.org,英文名称为 ena-DATASET-UCAM-GEL-15-04-2015-15:15:23:555-345 - samples。关于引用方式、许可协议、使用限制、是否允许再分发以及商业使用条件等,源站未提供。使用者在利用该数据集时,应自行确认源站的相关政策与要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001333

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自BRIDGE联盟样本的全外显子组测序BAM文件,这些样本在与出血或血小板疾病相关的基因上携带致病性或可能致病性变异。

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