HipSci 出血与血小板疾病外显子组测序数据集

数据内容为出血与血小板疾病相关样本的外显子组测序数据,可用于研究该类疾病的基因组变异特征,支持遗传学分析与疾病机制探索(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-SC-03-08-2017-09:30:33:086-1550 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

HipSci 出血与血小板疾病外显子组测序数据集

ena-DATASET-SC-03-08-2017-09:30:33:086-1550 - samples 是一个聚焦于血液与淋巴系统疾病领域、具体归属于出血性疾病方向的外显子组测序样本数据集。该数据集来源于 omicsdi.org,其源站描述指向 HipSci 项目下关于出血与血小板疾病(Bleeding and Platelet Disorders)的外显子测序工作,时间标注为 2017 年 7 月。数据集以 Genomics 作为主题标签,核心内容为出血与血小板疾病相关样本的外显子组测序数据,可用于研究该类疾病的基因组变异特征,并支持遗传学分析与疾病机制探索。整体而言,该数据集为出血性疾病及血小板相关疾病的基因组学研究提供了一个以样本为单位的外显子测序数据资源。

【数据集背景】

该数据集归属于血液与淋巴系统疾病这一大类,并进一步细分为出血性疾病方向。其源站描述明确指向 HipSci 项目中的“Bleeding and Platelet Disorders - Exome Sequencing - July 2017”工作。HipSci 通常与人类诱导多能干细胞相关研究相联系,而此处所涉及的是出血与血小板疾病主题下的外显子测序内容。数据集的主题标签为 Genomics,表明其定位于基因组学范畴。从时间信息看,该数据集与 2017 年 7 月的工作相对应,反映了该时期针对出血与血小板疾病所开展的外显子测序数据积累。源站未提供更多关于项目立项背景、资助来源或研究机构的具体信息。

【数据内容】

该数据集的核心内容为出血与血小板疾病相关样本的外显子组测序数据。外显子组测序针对基因组中的蛋白编码区域进行捕获与测序,因此该数据集所包含的数据可用于考察样本在外显子层面的变异情况。数据集名称中包含“samples”字样,提示其组织方式以样本为单位。结合源站描述中“Bleeding and Platelet Disorders”与“Exome Sequencing”的表述,可以确认数据内容围绕出血性疾病和血小板疾病两类主题展开。主题标签 Genomics 进一步说明其数据属性属于基因组学数据。源站未提供样本数量、测序平台、测序深度、变异检出格式、数据文件类型等具体技术细节。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述为“HipSci - Bleeding and Platelet Disorders - Exome Sequencing - July 2017”。据此可知,数据与 HipSci 项目相关,并聚焦于出血与血小板疾病的外显子测序,时间指向 2017 年 7 月。数据集英文名称中包含日期与时间戳信息“03-08-2017-09:30:33:086”,以及编号“1550”,这些信息可能用于标识该数据集在来源体系中的版本或批次,但源站未对其具体含义作出说明。除来源站与源站描述外,源站未提供样本采集地点、采集机构、伦理审批信息或具体合作方等更多来源细节。

【适用场景】

根据源站描述与主题标签,该数据集可用于出血与血小板疾病相关的基因组变异特征研究。具体而言,外显子组测序数据适合用于考察蛋白编码区域内的遗传变异,因此可支持针对出血性疾病和血小板疾病的遗传学分析。同时,该数据集也可用于疾病机制探索,例如从基因组层面寻找与出血或血小板功能异常相关的候选变异。由于主题标签为 Genomics,该数据集适用于基因组学范畴内的分析工作。源站未提供关于该数据集在特定研究项目中的具体应用案例、分析流程或已发表的关联研究成果。

【使用方法】

该数据集以样本为单位组织,名称为“ena-DATASET-SC-03-08-2017-09:30:33:086-1550 - samples”。使用者可依据样本维度对出血与血小板疾病相关的外显子组测序数据进行访问与分析。由于数据内容为外显子组测序数据,常规使用方式包括对测序读段进行比对、变异识别与注释,进而开展遗传学分析与疾病机制探索。主题标签 Genomics 提示其使用场景属于基因组学分析。源站未提供具体的数据下载方式、文件格式、访问协议、分析工具推荐或处理流程说明。

【质量与限制】

该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述指向 HipSci 项目下 2017 年 7 月的出血与血小板疾病外显子测序工作。其主题标签为 Genomics,数据内容为出血与血小板疾病相关样本的外显子组测序数据。源站未提供关于数据质量评估、测序覆盖度、样本合格标准、数据完整性或批次效应等方面的信息。此外,源站也未提供该数据集在样本量、人群代表性、疾病亚型覆盖范围等方面的限制说明。因此,关于质量与限制的具体内容,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,源站描述为“HipSci - Bleeding and Platelet Disorders - Exome Sequencing - July 2017”。数据集英文名称中包含编号“1550”以及时间戳信息。源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、DOI、许可协议或使用条款等具体信息。因此,关于引用与许可的具体内容,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003519

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

HipSci - Bleeding and Platelet Disorders - Exome Sequencing - July 2017

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