巴塞罗那医院诊所 RNA 测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org，为巴塞罗那医院诊所（Hospital Clinic Barcelona）的 RNASeq 测序样本，属于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病分类
基本信息
资源简介
巴塞罗那医院诊所 RNA 测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org，为巴塞罗那医院诊所（Hospital Clinic Barcelona）的 RNASeq 测序样本，属于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病分类。每个文库采用 TruSeq SBS Kit v3-HS 在 HiSeq2000 平台上以双端模式测序，读长 2×76 bp，每个样本产生超过 2000 万条双端读段。图像分析、碱基识别与质量评分使用 RTA 1.13.48 完成，并生成 FASTQ 序列文件。该数据可用于转录组层面的基因表达分析及相关疾病研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：RNASeq 测序。每个文库使用 TruSeq SBS Kit v3-HS 进行测序，采用双端模式，读长为 2 × 76 bp。我们按照制造商方案，在 HiSeq2000（Illumina Inc.）上以部分测序泳道为每个样本产生了超过 2000 万条双端读段。该运行的图像分析、碱基识别和质量评分使用制造商软件 Real Time Analysis（RTA 1.13.48）处理，随后生成 FASTQ 序列文件。
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：血液与淋巴系统疾病/出血性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001443
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001443
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
RNA测序。每个文库均使用TruSeq SBS Kit v3-HS进行测序，采用双端模式，读长为2 × 76 bp。我们按照制造商的操作规程，在HiSeq2000（Illumina公司）测序仪的部分测序通道上，为每个样本生成了超过2000万条双端读段。该测序运行的图像分析、碱基识别和质量评分使用制造商软件Real Time Analysis（RTA 1.13.48）进行处理，随后生成FASTQ序列文件。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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