47例血液与组织样本外显子组测序数据
该数据集来自 omicsdi.org,属于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病分类,主题标签为 Genomics。数据为 47 例血液与组织样本的外显子组文库,使用 Agilent SureSelect Human Exome Library Preparation V5 试剂盒与 Agilent Br

基本信息
资源简介
47例血液与组织样本外显子组测序数据
该数据集来自 omicsdi.org,属于血液与淋巴系统疾病下的出血性疾病分类,主题标签为 Genomics。数据为 47 例血液与组织样本的外显子组文库,使用 Agilent SureSelect Human Exome Library Preparation V5 试剂盒与 Agilent Bravo 自动化系统建库,并在 HiSeq 2500 平台上以 TruSeq SBS 测序化学和 V4 高通量流动池完成测序,每个外显子组文库产生约 6-8 gigabases 的 126-bases 双端原始数据。可用于外显子组层面的变异分析及相关疾病研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用 Agilent SureSelect Human Exome Library Preparation V5 试剂盒和 Agilent Bravo 自动化系统,从 47 份血液和组织样本中制备了外显子组文库。外显子组文库被混合后,按照 Illumina 推荐方案,在 HiSeq 2500 平台上使用 V4 高通量流动池,以 TruSeq SBS 测序化学进行测序。每个外显子组文库产生约 6-8 gigabases 的 126-bases 双端原始数据。
【主题与分类】
主题标签:Genomics。本站分类:血液与淋巴系统疾病/出血性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001007502
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001007502
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
使用Agilent SureSelect Human Exome Library Preparation V5试剂盒和Agilent Bravo自动化系统,从47份血液和组织样本中制备了外显子组文库。按照Illumina推荐的操作流程,将外显子组文库混合,并使用TruSeq SBS测序化学,在HiSeq 2500平台上采用V4高通量流动池进行测序。每个外显子组文库产生了约6-8吉碱基的126碱基双端原始数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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