AL 淀粉样变性患者与健康对照脂肪活检蛋白质谱

该数据集包含来自健康对照者以及 ALK(Kappa)型和 ALL(Lambda)型淀粉样变性患者的腹部皮下脂肪组织蛋白质谱

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
Protein profiles of fat biopsies from patients affected by AL amyloidosis and healthy controls.

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

AL 淀粉样变性患者与健康对照脂肪活检蛋白质谱

该数据集收录了来自健康对照者以及 ALK(Kappa)型和 ALL(Lambda)型淀粉样变性患者的腹部皮下脂肪组织蛋白质谱数据。淀粉样变性属于血液与淋巴系统疾病范畴,轻链型淀粉样变性可累及多器官系统,而腹部皮下脂肪组织因取材相对便捷,常被用于相关病理与生物标志物研究。本数据集以蛋白质组学为核心主题,围绕脂肪活检样本展开蛋白质层面的表征,旨在为比较患者与健康对照之间的蛋白质表达差异提供原始数据基础。数据来源于公开组学资源平台,原始数据由 LTQ、Orbitrap 和 QExactive 等质谱仪器采集,并关联了若干已发表的方法学文献,可供蛋白质组学、血液病学及淀粉样变性研究领域的科研人员参考使用。

【数据集背景】

淀粉样变性是一组由错误折叠蛋白形成淀粉样纤维并在组织中沉积所致的疾病,其中 AL 型淀粉样变性由免疫球蛋白轻链异常产生,可进一步分为 Kappa 型和 Lambda 型。腹部皮下脂肪组织活检是 AL 型淀粉样变性诊断与研究中常用的微创取材方式,对其蛋白质组成进行系统分析,有助于理解疾病相关的蛋白变化。该数据集正是在这一背景下,针对健康对照者与 ALK(Kappa)、ALL(Lambda)两类患者,采集腹部皮下脂肪组织的蛋白质谱信息,为相关机制研究和标志物探索提供数据支撑。

【数据内容】

数据集的核心内容是腹部皮下脂肪组织的蛋白质谱,样本覆盖三类人群:健康对照者、ALK(Kappa)型淀粉样变性患者以及 ALL(Lambda)型淀粉样变性患者。数据以蛋白质组学为标签,反映的是脂肪活检样本在蛋白质层面的整体图谱信息。源站描述中未逐一列出具体蛋白质种类、数量或定量结果,因此本数据集在蛋白质鉴定数目、差异蛋白列表等方面的细节,源站未提供。

【采集与来源】

样本类型为腹部皮下脂肪组织,来源于健康对照者及 ALK(Kappa)型和 ALL(Lambda)型淀粉样变性患者。原始数据通过 LTQ、Orbitrap 和 QExactive 三种质谱仪器采集。关于主要的色谱条件与方法学细节,源站指向了三篇文献,其标识分别为 doi:10.1182/blood-2011-07-365510、doi:10.3109/13506129.2012.674989 和 doi:10.3390/molecules26071913。数据集来源站为 omicsdi.org,本站分类归入血液与淋巴系统疾病 / 淀粉样变性。

【适用场景】

该数据集适用于蛋白质组学相关研究,尤其是围绕 AL 型淀粉样变性中脂肪组织蛋白质表达谱的分析。潜在应用包括:比较健康对照与 ALK(Kappa)、ALL(Lambda)患者之间的蛋白质谱差异;探索与轻链型淀粉样变性相关的候选生物标志物;为脂肪活检在淀粉样变性研究中的应用提供蛋白质层面的参考数据;以及作为方法学比较或数据再分析的素材。由于涉及三种质谱平台,也可用于跨平台数据特征的观察。

【使用方法】

使用者可依据源站提供的入口获取原始蛋白质谱数据,并结合源站描述中列出的三篇文献了解色谱与质谱方法细节。由于数据涉及患者与对照的分组信息,分析时可按健康对照、ALK(Kappa)和 ALL(Lambda)三类进行分组比较。具体的数据格式、下载方式、预处理流程及分析参数,源站未提供,需以实际获取的数据文件和相关文献为准。

【质量与限制】

该数据集的样本类型明确,分组涵盖健康对照与两种 AL 型淀粉样变性亚型,并采用多种质谱仪器采集,具备一定的蛋白质组学分析价值。但源站描述未提供样本量、蛋白质鉴定数量、定量方法、数据完整性及质控指标等信息,因此无法对数据规模与质量作出具体判断。此外,数据仅针对腹部皮下脂肪组织,结论不宜直接外推至其他组织或人群。相关限制需在使用时结合原始数据与文献自行评估。

【引用与许可】

源站描述中列出了三篇方法学相关文献的 DOI,分别为 doi:10.1182/blood-2011-07-365510、doi:10.3109/13506129.2012.674989 和 doi:10.3390/molecules26071913,使用该数据集时建议参考并引用这些文献。关于数据集的许可协议、使用条款及具体引用格式,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000090875

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自对照组受试者以及ALK(Kappa)和ALL(Lambda)型淀粉样变性患者的腹部皮下脂肪组织蛋白质谱。原始数据通过LTQ、Orbitrap和QExactive仪器采集。主要色谱细节参见doi:10.1182/blood-2011-07-365510、doi:10.3109/13506129.2012.674989、doi:10.3390/molecules26071913。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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