人CB CD34+细胞中缺氧、HIF1与HIF2靶基因的鉴定

源站描述指出该SuperSeries由下列SubSeries组成,具体信息需参考各独立Series。数据可用于转录组层面研究人CB CD34+细胞在缺氧及HIF1、HIF2调控下的靶基因鉴定,支撑血液与淋巴系统疾病及淀粉样变性相关机制探索(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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时间序列预测Transcriptomics
Identification of hypoxia, HIF1 and HIF2 target genes in human CB CD34+ cells

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

人CB CD34+细胞中缺氧、HIF1与HIF2靶基因的鉴定

该数据集英文名为 Identification of hypoxia, HIF1 and HIF2 target genes in human CB CD34+ cells,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Transcriptomics,在站内归类于血液与淋巴系统疾病 / 淀粉样变性方向。源站描述指出,该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,具体信息需参考各独立 Series。基于这一描述,该数据可用于在转录组层面研究人 CB CD34+ 细胞在缺氧以及 HIF1、HIF2 调控条件下的靶基因鉴定,并支撑血液与淋巴系统疾病及淀粉样变性相关机制的探索。整体而言,该数据集围绕缺氧与 HIF 信号相关靶基因的转录组研究展开,适合关注造血细胞缺氧应答及血液系统疾病机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集聚焦于人 CB CD34+ 细胞中缺氧、HIF1 与 HIF2 靶基因的鉴定。CB CD34+ 细胞通常与造血干/祖细胞研究相关,而缺氧及 HIF1、HIF2 是细胞应对低氧环境的重要调控因子。源站描述表明,该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,具体信息需参考各独立 Series。因此,该数据集在背景上定位于转录组学层面,用于探索缺氧及 HIF1、HIF2 对人 CB CD34+ 细胞靶基因的调控情况,并与血液与淋巴系统疾病 / 淀粉样变性这一站内分类方向相关联。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptomics,说明其内容属于转录组数据范畴。源站描述仅指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,并提示参考各独立 Series,未提供更具体的样本数量、测序平台、基因列表、差异表达结果或靶基因清单。因此,关于数据内容的具体组成、文件类型、数据规模及分析结果,源站未提供。可以确认的是,该数据集围绕缺氧、HIF1 和 HIF2 靶基因鉴定这一主题组织,并以 SuperSeries 与 SubSeries 的结构形式呈现。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,具体信息需参考各独立 Series。除来源站与这一结构说明外,关于样本采集方式、细胞来源细节、实验处理条件、测序或检测平台、数据提交机构及原始研究团队等信息,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述与主题标签,该数据集可用于转录组层面研究人 CB CD34+ 细胞在缺氧及 HIF1、HIF2 调控下的靶基因鉴定,并支撑血液与淋巴系统疾病及淀粉样变性相关机制探索。适用场景包括:关注缺氧信号通路与 HIF1、HIF2 调控的研究;关注人 CB CD34+ 细胞转录组变化的研究;以及希望从转录组角度探索血液与淋巴系统疾病或淀粉样变性相关机制的研究。由于源站未提供具体分析结果与样本信息,实际适用性仍需结合各独立 Series 判断。

【使用方法】

源站描述指出,该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,具体信息需参考各独立 Series。因此,使用该数据集时,应首先查阅各独立 Series 的说明,以了解具体样本、实验条件与数据内容。关于数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具及预处理步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在站内归类于血液与淋巴系统疾病 / 淀粉样变性,主题标签为 Transcriptomics,来源站为 omicsdi.org。源站描述仅说明该 SuperSeries 由若干 SubSeries 组成,并提示参考各独立 Series,未提供质量控制指标、批次信息、重复数、测序深度、覆盖度或验证实验结果。因此,关于数据质量的具体评价,源站未提供。使用时应以各独立 Series 的信息为准,并注意该数据集描述中未给出可直接引用的分析结论或靶基因列表。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制及版权信息,源站未提供。源站描述仅指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,具体信息需参考各独立 Series。因此,引用与许可相关事项应进一步查阅各独立 Series 或来源站 omicsdi.org 的相应说明。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-54663

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below. Refer to individual Series

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