GSE24128:AL淀粉样变性基线浆细胞中的Cyclin D1

该数据集来自NCBI,聚焦AL淀粉样变性患者基线骨髓浆细胞的Cyclin D1表达。可用于研究Cyclin D1在AL淀粉样变性浆细胞中的表达特征,并支持相关样本的分类分析(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5719606
GSE24128: Cyclin D1 in AL Amyloidosis Baseline Plasma Cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE24128:AL淀粉样变性基线浆细胞中的Cyclin D1

GSE24128 数据集来自 NCBI,主题为 AL 淀粉样变性患者基线骨髓浆细胞中的 Cyclin D1 表达。该数据集以 CD138 分选的新诊断 AL 患者骨髓浆细胞为研究对象,采用表达谱芯片技术检测 Cyclin D1 的表达情况,属于血液与淋巴系统疾病 / 淀粉样变性分类下的表达谱数据。数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE24128_series_matrix.txt.gz,由 Raymond L Comenzo 提交,发布时间为 201 年 9 月 14 日。该数据可用于研究 Cyclin D1 在 AL 淀粉样变性浆细胞中的表达特征,并支持相关样本的分类分析。

【数据集背景】

AL 淀粉样变性是一种与浆细胞异常相关的血液系统疾病,异常浆细胞产生错误折叠的轻链蛋白并沉积于组织器官。CD138 是浆细胞表面的标志性分子,通过 CD138 分选可以获得较为富集的骨髓浆细胞群体。该数据集聚焦于新诊断 AL 淀粉样变性患者基线状态下的骨髓浆细胞,检测 Cyclin D1 的表达情况,为理解该疾病中浆细胞的生物学特征提供表达谱层面的数据基础。

【数据内容】

数据集包含 1 个数据文件,样例文件名为 GSE24128_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。主题标签显示其数据类型为 Expression profiling by array,涉及平台 GPL571 与物种编号 9606。源站描述指出,研究对来自新诊断 AL 患者的 CD138 分选骨髓浆细胞进行了 Cyclin D1 表达检测。除上述信息外,样本数量、分组设计、探针注释及具体表达矩阵内容源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 Cyclin D1 in AL Amyloidosis Baseline Plasma Cells,数据集英文名为 GSE24128: Cyclin D1 in AL Amyloidosis Baseline Plasma Cells。作者为 Raymond L Comenzo,发布时间为 201 年 9 月 14 日。研究对象为新诊断 AL 淀粉样变性患者的骨髓浆细胞,经 CD138 分选后用于 Cyclin D1 表达研究。其余关于采集地点、伦理审批及样本处理流程的细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究 Cyclin D1 在 AL 淀粉样变性患者基线浆细胞中的表达特征,支持相关样本的分类分析。适合作为表达谱芯片数据分析的输入,用于探索浆细胞标志基因的表达模式,也可为 AL 淀粉样变性与其他浆细胞疾病之间的比较研究提供参考数据。具体分析设计需结合平台注释与样本信息,相关细节源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE24128_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件,读取时应关注系列矩阵中的样本与表达值组织方式,并结合 GPL571 平台信息进行注释。更详细的处理步骤源站未提供。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,属于系列矩阵汇总文件,未提供原始芯片图像或未处理数据。样本量、重复设计、质控指标及缺失值情况源站未提供。使用时应自行评估数据完整性与适用性,避免超出数据实际覆盖范围外推结论。

【引用与许可】

引用该数据集时应注明来源站 ncbi.nlm.nih.gov、数据集编号 GSE24128 及作者 Raymond L Comenzo。许可条款与使用限制源站未提供,使用前应查阅源站相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24128

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

研究了新诊断AL患者经CD138选择的骨髓浆细胞的cyclin D1表达。我们识别出浆细胞过表达cyclin D1的患者,并将其与细胞未过表达cyclin D1的患者进行了比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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