人球后视神经蛋白质组

主题标签:眼病、视神经炎、蛋白质组、视神经、人。本站分类:眼病/视神经炎。本数据集为眼病领域公开数据集,主题涵盖眼病。本数据集为眼病领域的蛋白质公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖眼病。

google_dataset
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蛋白质眼病视神经炎蛋白质组视神经人
The proteome of human retrobulbar optic nerve

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

人球后视神经蛋白质组

The proteome of human retrobulbar optic nerve 是一个面向眼病研究领域的公开蛋白质组数据集,主题涵盖眼病、视神经炎、蛋白质组、视神经与人等关键词,在分类上归属于眼病/视神经炎方向。该数据集由 Pingbo Zhang 提交,收录于 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD001581。数据集以人类球后视神经为研究对象,围绕其蛋白质组展开,可为视神经相关疾病尤其是视神经炎的分子层面研究提供公开数据资源。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面对该数据集作进一步介绍。

【数据集背景】

视神经是连接眼球与中枢神经系统的重要结构,球后视神经段位于眼球后方,其蛋白质组成与视神经的生理功能及病理过程密切相关。视神经炎是眼病领域关注的重要疾病之一,涉及视神经的炎症性损伤。该数据集以人类球后视神经的蛋白质组为主题,属于眼病/视神经炎分类下的公开数据集,主题标签包括眼病、视神经炎、蛋白质组、视神经和人,体现了将蛋白质组学方法应用于视神经相关眼病研究的取向。

【数据内容】

该数据集的主题为人类球后视神经的蛋白质组,关键词覆盖眼病、视神经炎、蛋白质组、视神经与人。数据集名称明确指向“人类球后视神经的蛋白质组”,表明其内容围绕该组织的蛋白质组展开。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数量、仪器平台、实验流程等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,收录于 PRIDE 归档平台,项目编号为 PXD001581,提交者为 Pingbo Zhang。源站描述为:Pingbo Zhang, The proteome of human retrobulbar optic nerve [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001581。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批及实验设计等信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集可应用于眼病特别是视神经炎相关的蛋白质组研究场景,例如作为视神经蛋白质组参考数据用于方法比较、候选分子筛选的思路验证,或作为公开数据资源支持视神经相关疾病的分子机制探索。由于数据集归属于眼病/视神经炎方向,也可用于该领域教学与文献调研中的数据引用。关于具体的适用分析类型与验证结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档平台公开,项目编号为 PXD001581,使用者可依据该编号在 PRIDE 中检索并获取数据集。关于数据文件的具体格式、下载方式、预处理步骤及分析工具建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开归档数据集,来源站为 ebi.ac.uk,提交者为 Pingbo Zhang。关于数据质量评估指标、完整性、批次效应、样本代表性及技术局限等信息,源站未提供。使用时应结合源站描述与项目页面信息自行判断其适用范围。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述:Pingbo Zhang, The proteome of human retrobulbar optic nerve [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001581。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001581

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Pingbo Zhang, The proteome of human retrobulbar optic nerve [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001581

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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