Arid1a的缺失促进视神经损伤后神经元的存活
该数据集包含小鼠视神经损伤模型中的基因表达、细胞存活与轴突再生数据，涉及分子、细胞和转录组等多模态信息，主要用于研究Arid1a基因在视神经损伤后调控视网膜神经节细胞存活及凋亡与JAK/STAT信号通路的作用，为神经保护和再生医学提供基础研究支持。
基本信息
资源简介
Arid1a的缺失促进视神经损伤后神经元的存活
【数据集背景】
源站首次发布：2023-04-28。
【数据内容】
源站原始描述：视神经损伤引起 Arid1a 表达的动态变化，删除小鼠体内的 Arid1a 可显著提高 RGC 的存活率，但对视神经损伤后轴突再生的影响不大，其次，成熟 RGCs 中转录本和可接近染色质的联合分析表明，Arid1a 调控多个参与凋亡和 JAK/STAT 信号通路的基因。
【主题与分类】
主题标签：Arid1a、视神经损伤、视网膜神经节细胞、存活、Arid1a、optic nerve crush、retinal ganglion cell、survival、Mus musculus、视网膜。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b896ff45ac97dd8ad0a7c
使用许可：CC BY 4.0。
规范引用：35786.11.b2870981ec1e4d10a74fe17ed331fd9a
下载信息
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源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=644b896ff45ac97dd8ad0a7c
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于视神经损伤后神经元的存活机制研究，主要探讨Arid1a基因在其中的作用。数据集包含小鼠视神经损伤模型中视网膜神经节细胞（RGCs）存活率、轴突再生情况以及Arid1a表达动态变化的实验数据。通过基因敲除技术删除小鼠体内的Arid1a，并分析其对RGC存活和再生的影响。此外，数据集还整合了成熟RGCs的转录组和染色质可及性分析，揭示了Arid1a调控凋亡和JAK/STAT信号通路相关基因的分子机制。该数据集主要应用于神经科学和基因研究领域，为视神经损伤修复和神经保护策略提供实验依据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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