WSI 胶质瘤数据集

数据集获取

源站：https://hyper.ai/cn/datasets/33104

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集是清华大学与中南大学湘雅医院合作论文《A transformer-based weakly supervised computational pathology method for clinical-grade diagnosis and molecular marker discovery of gliomas》中使用的数据集。它包含两个部分：一是公开可获取的TCGA公共胶质瘤全切片图像（WSI）数据，可从美国国立卫生研究院的基因组数据共享中心获取；二是湘雅胶质瘤WSI数据集，由于患者隐私保护要求，该部分不对外开放。数据集提供了胶质瘤的病理图像样本及相应标签，主要用于胶质瘤的临床诊断、分子标志物发现以及基于深度学习的弱监督计算病理学研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。