人尼曼-匹克C1蛋白晶体结构
该数据集包含通过X射线衍射测定的人尼曼-匹克C1蛋白的晶体结构数据,以蛋白质三维坐标和配体结合信息为主要模态,揭示了其C端结构域在胆固醇转运中的功能机制,主要用于尼曼-匹克病病理研究、胆固醇代谢调控及基于结构的药物设计等方向。

基本信息
资源简介
人尼曼-匹克C1蛋白晶体结构
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Crystal structure of human Niemann-Pick C1 protein》。
【数据内容】
源站原始描述:membrane protein
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1073/pnas.1711716114。
【主题与分类】
主题标签:MEMBRANE PROTEIN。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/5U73
规范引用:3.3 angstrom structure of Niemann-Pick C1 protein reveals insights into the function of the C-terminal luminal domain in cholesterol transport. (2017) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/5u73
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集收录了人尼曼-匹克C1(NPC1)蛋白的晶体结构数据,分辨率约为3.348 Å。数据包含蛋白质的三维原子坐标、配体(如2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖及其二聚体)结合信息以及相关元数据。该结构通过X射线衍射方法测定,于2016年12月提交,2017年9月公开发布。研究揭示了NPC1蛋白C端腔结构域在胆固醇转运中的功能机制,为理解尼曼-匹克病的病理基础及胆固醇代谢调控提供了关键结构依据,适用于结构生物学、疾病机制研究和药物设计等领域。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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