GAINSeq:基于下一代测序数据与机器学习模型的青光眼症状前检测
该数据集来自 search.dataone.org,属于眼及附器疾病中的青光眼方向,围绕先天性青光眼及相关病症的遗传突变信息构建

基本信息
资源简介
GAINSeq:基于下一代测序数据与机器学习模型的青光眼症状前检测
GAINSeq: Glaucoma Pre-Symptomatic Detection Using Machine Learning Models Driven by Next-Generation Sequencing Data
该数据集来自 search.dataone.org,属于眼及附器疾病中的青光眼方向,围绕先天性青光眼及相关病症的遗传突变信息构建。数据涵盖多种遗传变异的染色体位置、起止位点、参考等位基因与突变等位基因、reads 计数以及变异 reads 百分比,同时提供基因名称、基因 ID、基因大小和受影响的具体外显子等信息。结合其主题标签,该数据可用于机器学习驱动的青光眼症状前检测研究,支持基因组学与生物信息学分析(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该文件包含一个与先天性青光眼及其他相关病症相关的遗传突变综合数据集。文件涵盖多种遗传变异的详细信息,包括其染色体位置、起始和终止位置、参考等位基因与突变等位基因、reads 计数以及变异 reads 的百分比。它还提供基因名称、基因 ID、基因大小以及受这些突变影响的具体外显子的数据。
【主题与分类】
主题标签:Computer and Information Science、Medicine, Health and Life Sciences。本站分类:眼及附器疾病/青光眼。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A514a9204744fc25c7e6dccd2a9f12be6e8c3d3dfaa55d8426c55eabf83d11456
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该文件包含了一个综合数据集,涉及与先天性青光眼及其他相关条件相关的基因突变。文件详细记录了各种遗传变异的信息,包括其染色体位置、起始和终止位置、参考等位基因与突变等位基因、阅读计数以及变异阅读的百分比。此外,还提供了基因名称、基因ID、基因大小以及受这些突变影响的具体外显子数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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