原发性青光眼患者房水中细胞外基质调控相关蛋白的检测
该数据集来自一项关于原发性青光眼患者房水蛋白质组的研究，包含补充图与补充表格共2个文件。研究比较了原发性开角型青光眼、原发性闭角型青光眼与白内障对照的房水蛋白浓度，并通过质谱检测及Western blot和免疫比浊法验证骨桥蛋白、组织蛋白酶D和胱抑素C等细胞外基质调控相关蛋白
基本信息
资源简介
原发性青光眼患者房水中细胞外基质调控相关蛋白的检测
Detection of Proteins Associated with Extracellular Matrix Regulation in the Aqueous Humour of Patients with Primary Glaucoma
该数据集来自一项关于原发性青光眼患者房水蛋白质组的研究，包含补充图与补充表格共2个文件。研究比较了原发性开角型青光眼、原发性闭角型青光眼与白内障对照的房水蛋白浓度，并通过质谱检测及Western blot和免疫比浊法验证骨桥蛋白、组织蛋白酶D和胱抑素C等细胞外基质调控相关蛋白。数据可用于青光眼生物标志物发现与房水蛋白差异分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Detection of Proteins Associated with Extracellular Matrix Regulation in the Aqueous Humour of Patients with Primary Glaucoma》发表于 Current Eye Research（2019），DOI：10.1080/02713683.2019.1608261。项目资助方：This work was supported by the Indian Council of Medical Research under the grant number 5/4/6/4/oph/12-NCD-II.。源站首次发布：2019-05-08。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：房水（AH）的蛋白质组成一直具有重要意义，并且仍然是青光眼生物标志物发现中的主要样本。本研究的目的是分析原发性开角型青光眼（POAG）和原发性闭角型青光眼（PACG）中的房水蛋白浓度，并进一步检查与白内障对照相比的蛋白质组变化。本研究从90例POAG、72例PACG、78例白内障（对照）中采集房水。总蛋白使用Bradford法进行定量。样本经胰蛋白酶消化后，进行液相色谱-质谱联用（LC-MS）用于蛋白质组学研究（每组n = 3）。细胞外基质对房水外流有主要影响，通过质谱检测到的调节蛋白骨桥蛋白（OPN）、组织蛋白酶D和胱抑素C在房水样本中通过Western blot和比浊免疫测定法进行了验证。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 843.10 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.8094566.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。主题标签：Glaucoma、aqueous humour、osteopontin、cystatin C、cathepsin D。本站分类：眼及附器疾病/青光眼。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Physiology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Detection_of_Proteins_Associated_with_Extracellular_Matrix_Regulation_in_the_Aqueous_Humour_of_Patients_with_Primary_Glaucoma/8094566
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Detection of Proteins Associated with Extracellular Matrix Regulation in the Aqueous Humour of Patients with Primary Glaucoma. Taylor & Francis. Nikhalashree, Sampath; George, Ronnie; Shantha, Balekudaru; Lingam, Vijaya; Vidya, Wadke; Panday, Manish; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.8094566
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 843.1 KB。
数据说明
房水（AH）的蛋白质组成一直具有重要意义，并且仍然是青光眼生物标志物发现中的主要样本。本研究的目的是分析原发性开角型青光眼（POAG）和原发性闭角型青光眼（PACG）中房水蛋白质浓度，并进一步检查与白内障对照相比的蛋白质组变化。本研究从90例POAG、72例PACG、78例白内障（对照）中采集房水。使用Bradford法对总蛋白进行定量。样品经胰蛋白酶消化后进行液相色谱-质谱联用（LC-MS）用于蛋白质组学研究（每组 n = 3）。细胞外基质对房水外流有主要影响，通过质谱检测到的调节蛋白骨桥蛋白（OPN）、组织蛋白酶D和胱抑素C在房水样品中通过Western blot和浊度免疫分析法进行了验证。我们观察到POAG的蛋白质水平显著升高（ p = .0009）；有趣的是，与白内障（ p < .0001）和POAG（ p = .02）相比，PACG也出现类似升高。蛋白质组学分析在对照、POAG和PACG中分别鉴定出184、190和299种蛋白质。
与对照组相比，OPN在POAG（p = .0319）和PACG（p = .0103）中升高。组织蛋白酶D的前体形式在POAG中升高，在PACG中降低，但与对照组相比无显著性差异。与对照组相比，胱抑素C在POAG（p = .0310）和PACG（p = .0125）中均升高。在本研究中，我们首次报道PACG队列的总蛋白高于对照组。蛋白质组的定性比较显示，PACG中鉴定出的蛋白质数量增加。我们推测，POAG和PACG中OPN和胱抑素C水平升高以及组织蛋白酶水平改变可能促进青光眼中的ECM异常。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
