小鼠胚胎眼发育视裂转录谱分析

该数据集来自ebi.ac.uk,为小鼠胚胎眼发育过程中视裂的转录谱分析数据。源站描述显示,通过矢状切片可清晰观察视裂在开放(E10.5)、闭合(E11.5)和融合(E12.5)三种状态下的形态,并采用激光捕获显微切割(LCM)从视裂边缘分离外(推定的RPE)和内(推定的神经感觉视网膜)层组织,每侧切

biostudies
浏览 8
医学影像分类transcription profiling by arrayMus musculus
Transcription profiling of mouse embryo eye development, specifically optic fissure.

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

小鼠胚胎眼发育视裂转录谱分析

Transcription profiling of mouse embryo eye development, specifically optic fissure.

该数据集来自ebi.ac.uk,为小鼠胚胎眼发育过程中视裂的转录谱分析数据。源站描述显示,通过矢状切片可清晰观察视裂在开放(E10.5)、闭合(E11.5)和融合(E12.5)三种状态下的形态,并采用激光捕获显微切割(LCM)从视裂边缘分离外(推定的RPE)和内(推定的神经感觉视网膜)层组织,每侧切取约50×50 mm的方形视裂块。RNA经两轮线性扩增后进行微阵列杂交,E10.5和E11.5各设生物学三重复,E12.5设二重复,每个阵列代表来自同一窝三只胚胎的混合视裂组织。该数据可用于研究视裂闭合相关基因表达变化(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在小鼠早期发育过程中,通过眼矢状切片可以清晰观察到视裂的不同阶段,分别代表视裂的开放(E10.5)、闭合(E11.5)和融合(E12.5)状态。采用激光捕获显微切割(LCM)从视裂边缘分离组织,该组织由视网膜外层(推定的RPE)和内层(推定的神经感觉视网膜)组成。从视裂每侧切取约50 x 50 mm的方形视裂块。在微阵列杂交之前,对每个样本分离的RNA进行两轮线性扩增。在E10.5和E11.5收集生物学三重复的表达数据,在E12.5收集二重复数据,每个阵列代表来自同一窝三只胚胎的混合视裂组织。表达信号为

【主题与分类】

主题标签:transcription profiling by array、Mus musculus。本站分类:眼病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-13103

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-13103 小鼠胚胎眼发育的转录谱分析,特别是视裂。通过微阵列进行的转录谱分析 EFO EFO_0002768 小家鼠 在小鼠眼早期阶段进行矢状切片,可以清晰地观察到视裂的不同阶段。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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