光感受器丢失不招募中性粒细胞尽管小胶质细胞强烈激活

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aad582882c04dd71546a11b3e11971a022c928e310073f1e67af5f47c07ccb7f7

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数据说明

在中枢神经系统（CNS）损伤反应中，小胶质细胞等组织驻留免疫细胞以及循环系统中的中性粒细胞往往是最先响应的细胞。这些细胞在应对CNS损伤时相互作用的程度尚知之甚少，在神经视网膜中更是如此，这给活体高分辨率成像带来了挑战。在本研究中，我们采用荧光自适应光学扫描光检眼镜（AOSLO）对小鼠的小胶质细胞和中性粒细胞进行研究。我们利用无标记相衬AOSLO在微米级分辨率下同时追踪免疫细胞的动态变化。通过将488 nm激光聚焦于光感受器（PR）外段诱导视网膜病变。这些病变局部消融了PR，对聚焦平面上方和下方细胞的附带损伤极小。我们利用活体成像（AOSLO、SLO和OCT）揭示了损伤后数分钟至数月内小胶质细胞和中性粒细胞反应的自然历程。

虽然小胶质细胞表现出动态且渐进…，，，# 光感受器丢失尽管小胶质细胞强烈激活，但并未招募中性粒细胞 数据集DOI：10.5061/dryad.w3r228143 ## 数据和文件结构说明 其中的数据文件主要是为提交至eLife的论文“光感受器丢失尽管小胶质细胞强烈激活，但并未招募中性粒细胞”所获取的视频和图像。 ### 文件和变量 #### 文件：Lesion_paper_data.zip **说明：**Â 3个子文件夹包含使用自适应光学扫描光 ophthalmoscopy（AOSLO，简称AO）、扫描激光 ophthalmoscope（Heidelberg Spectralis，简称HRA）以及离体共聚焦显微镜获取的数据。在每个子文件夹内，如下所示：Â AOdata–>小鼠品系和其他标签–>采集模式（共聚焦或相差，此文件夹并非总是存在）–>小鼠编号和采集日期。exVivoConfocaldata–>用于组织学的小鼠品系和其他标签–>小鼠编号和采集日期。HRAdata–>小鼠编号和采集

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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