大西洋鲑与虹鳟在适宜及高温下养殖的晶状体代谢组学分析用于理解白内障发生
该数据集来自 plos.figshare.com，包含 4 个 Excel 表格文件，围绕大西洋鲑与虹鳟在 13°C 和 19°C 海水温度下养殖 35 天的晶状体代谢组学与白内障发生研究
基本信息
资源简介
大西洋鲑与虹鳟在适宜及高温下养殖的晶状体代谢组学分析用于理解白内障发生
Lens metabolomic profiling as a tool to understand cataractogenesis in Atlantic salmon and rainbow trout reared at optimum and high temperature
该数据集来自 plos.figshare.com，包含 4 个 Excel 表格文件，围绕大西洋鲑与虹鳟在 13°C 和 19°C 海水温度下养殖 35 天的晶状体代谢组学与白内障发生研究。源站描述指出，高温或波动水温会增加养殖鲑鳟鱼的白内障患病率和严重程度；实验结束时大西洋鲑白内障患病率接近 100%，虹鳟约 50%，且大西洋鲑白内障严重程度几乎高出三倍。数据可用于比较两种鱼在不同温度下的晶状体代谢与白内障发展差异（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Lens metabolomic profiling as a tool to understand cataractogenesis in Atlantic salmon and rainbow trout reared at optimum and high temperature》发表于 PLOS ONE（2017），DOI：10.1371/journal.pone.0175491。源站首次发布：2017-04-18。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：高海水温度或波动海水温度时期会给养殖鲑鳟鱼带来多种生理挑战，包括白内障患病率和严重程度的增加。本研究的目的是比较在两种温度下养殖的大西洋鲑（Salmo salar L.）和虹鳟（Oncorhynchus mykiss）的白内障发生，并探究温度是否影响晶状体代谢和白内障发展。大西洋鲑（101±2 g）和虹鳟（125±3 g）在 13°C（生长最适温度）或 19°C 的海水中养殖，实验持续 35 天（每个处理 n = 4 个水槽）。实验结束时，无论温度如何，大西洋鲑的白内障患病率接近 100%，而虹鳟约为 50%。通过裂隙灯检查晶状体评估的白内障严重程度，在大西洋鲑中几乎高出三倍。
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 281.91 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0175491。
【主题与分类】
源站学科分类：Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Inorganic Chemistry、Virology。主题标签：Salmo salar L、Atlantic salmon、cataractogenesi、seawater temperatures result、temperature influences lens metabolism、cataract development、lens carbohydrate metabolism、35 days experiment、rainbow trout。本站分类：眼及附器疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified、Inorganic Chemistry、Virology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Lens_metabolomic_profiling_as_a_tool_to_understand_cataractogenesis_in_Atlantic_salmon_and_rainbow_trout_reared_at_optimum_and_high_temperature/4885568
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Remø, Sofie Charlotte; Hevrøy, Ernst Morten; Breck, Olav; Olsvik, Pål Asgeir; Waagbø, Rune (2017). Lens metabolomic profiling as a tool to understand cataractogenesis in Atlantic salmon and rainbow trout reared at optimum and high temperature. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Lens metabolomic profiling as a tool to understand cataractogenesis in Atlantic salmon and rainbow trout reared at optimum and high temperature
- DOI：10.1371/journal.pone.0175491
- 发布日期：2017-04-18
- 文件数：4 个
- 文件总体积：281.91 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Lens_metabolomic_profiling_as_a_tool_to_understand_cataractogenesis_in_Atlantic_salmon_and_rainbow_trout_reared_at_optimum_and_high_temperature/4885568
命令行下载
curl -L -o "S1 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8215271"
curl -L -o "S2 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8215304"
curl -L -o "S3 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8215310"
curl -L -o "S4 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8215340"
文件清单
S1 Table.xlsx（245.59 KB）S2 Table.xlsx（12.72 KB）S3 Table.xlsx（12.42 KB）S4 Table.xlsx（11.18 KB）
文件总体积 281.91 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
高水温或波动的水温时期会给养殖鲑科鱼类带来若干生理挑战，其中包括白内障患病率和严重程度的增加。本研究旨在比较在两种温度下养殖的大西洋鲑（Salmo salar L.）和虹鳟（Oncorhynchus mykiss）的白内障发生情况，并探究温度是否影响晶状体代谢和白内障发展。大西洋鲑（101±2 g）和虹鳟（125±3 g）在13°C（生长最适温度）或19°C的海水中养殖，实验持续35天（每个处理组n = 4个水箱）。实验结束时，无论温度如何，大西洋鲑的白内障患病率接近100%，而虹鳟约为50%。通过裂隙灯检查晶状体评估的白内障严重程度，大西洋鲑几乎是虹鳟的三倍。全局代谢谱揭示了两个物种在晶状体组成和代谢方面的差异，这可能解释了所观察到的物种间白内障易感性差异。
最大的差异出现在氨基酸代谢，尤其是组氨酸代谢，这一点通过独立的定量分析得到了证实。整体代谢谱显示，在晶状体碳水化合物代谢、渗透调节和氧化还原稳态方面存在温度依赖性差异。本研究的结果为大西洋鲑和虹鳟在高温养殖条件下的白内障发生机制提供了新的见解，并且识别出了用于白内障发展的代谢标志物。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0175491（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Lens_metabolomic_profiling_as_a_tool_to_understand_cataractogenesis_in_Atlantic_salmon_and_rainbow_trout_reared_at_optimum_and_high_temperature/4885568）。
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