大西洋鲑IgM+ B细胞表面蛋白质组复制数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A79af0973f1438b6f69108e0bc6abe32fdda9cd7e4e0b32ba2d2e2e12e51db183

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

由质谱法从大西洋鲑（Salmo salar）B细胞和/或头肾细胞系中鉴定出的蛋白质组合数据集。从ASK和SSP-9细胞系、初始IgM+外周血白细胞（PBLs）以及对照组与LPS刺激的IgM+ PBLs中分离的表面蛋白进行了蛋白质组学分析。使用Proteome Discoverer 2.2软件分析QExactive原始文件，并通过内部Mascot服务器将碎片光谱与NCBI非冗余（nr）Salmo salar 2017_1数据库进行比对搜索。摘要：随着功能性免疫测定方法的日益普及和组学方法的重大进展，鱼类免疫学研究正处于关键时期。然而，由于差异表达表面标记物的可用性有限，对鱼类B细胞及其不同亚群的研究仍面临挑战。为克服这一限制，通过质谱法分析了大西洋鲑IgM+ B细胞的细胞表面蛋白质组，并与从两种贴壁鲑头肾细胞系ASK和SSP-9中检测到的表面蛋白进行了比较。

在鲑鱼IgM+ B细胞上鉴定出的21种分化簇（CD）分子中，基于其哺乳动物同源物已报道的B细胞特异性表面表达，CD22和CD79A被列为潜在标志物的候选。随后对头肾白细胞经流式细胞术分选亚群进行的RT-qPCR分析证实，cd22和cd79a基因在IgM+淋巴样细胞中高表达，但在IgM-非淋巴样悬浮细胞和贴壁细胞中几乎检测不到。同样，在脾脏和腹腔的IgM+或IgT+淋巴样细胞中观察到显著高的cd22和cd79a mRNA水平，而在相应的IgM- IgT-非淋巴样组分中则未观察到。这表明CD22和CD79A的B细胞限制性表达延伸至转录水平，且在不同淋巴组织隔室和免疫球蛋白同种型中保持一致，从而强烈支持CD22的潜力

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。