人类角膜蛋白质组图谱

主题标签:眼病、表层巩膜炎、角膜、蛋白质组、人类。本站分类:眼病/表层巩膜炎。本数据集为眼病领域公开数据集,主题涵盖眼病。

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蛋白质眼病表层巩膜炎角膜蛋白质组人类
A proteomic landscape of the human cornea

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

人类角膜蛋白质组图谱

A proteomic landscape of the human cornea 是一个面向眼病研究领域的公开蛋白质组数据集,来源为 EBI(ebi.ac.uk)平台,由 Keshava Prasad T. S. 提交。该数据集以人类角膜为研究对象,围绕角膜蛋白质组展开,主题标签涵盖眼病、表层巩膜炎、角膜、蛋白质组与人类。在本站分类体系中,该数据集归入眼病 / 表层巩膜炎方向,属于眼病领域可公开获取的数据资源之一,可为角膜相关基础研究与眼病机制探索提供蛋白质层面的数据参考。

【数据集背景】

角膜是眼表的重要结构,其蛋白质组成与眼表生理功能及多种眼病的发生发展密切相关。蛋白质组学方法能够从整体层面刻画组织中的蛋白质构成,为理解角膜的生物学特性以及眼病相关分子改变提供基础数据。该数据集以“人类角膜的蛋白质组全景”为主题,定位于眼病研究方向,并在本站分类中与表层巩膜炎这一眼病类别相关联,服务于眼病领域的公开数据需求。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括眼病、表层巩膜炎、角膜、蛋白质组与人类,表明其内容围绕人类角膜的蛋白质组信息组织,并归属于眼病主题范畴。数据集英文名称为 A proteomic landscape of the human cornea。除上述主题与分类信息外,源站未提供关于样本数量、蛋白质鉴定数目、实验分组、文件格式及数据规模的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为 Keshava Prasad T. S. 的 “A proteomic landscape of the human cornea”,并附有 PRIDE Archive 项目地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009261。据此可知该数据集通过 EBI 的 PRIDE Archive 平台公开,项目编号为 PXD009261。关于具体的样本采集方式、实验流程与仪器参数,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集可应用于眼病领域的相关研究,尤其是围绕角膜蛋白质组的基础分析,以及与本站在分类中列出的表层巩膜炎方向相结合的数据参考。它适合作为角膜蛋白质层面研究的公开数据资源,用于支持眼病主题下的数据检索与二次利用。关于具体的适用分析类型与方法学用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站给出的 PRIDE Archive 项目地址(PXD009261)进行访问与获取。关于数据下载格式、文件组织方式、使用步骤及配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI 平台公开的数据集资源,其来源与项目编号明确。关于数据质量评估指标、覆盖度、完整性及已知局限性,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述中的形式:Keshava Prasad T. S., A proteomic landscape of the human cornea [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009261。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009261

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Keshava Prasad T. S., A proteomic landscape of the human cornea [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009261

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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