评估眼组织缺损患者变异中肌动蛋白通路相互作用
主题标签：眼病、眼组织缺损、肌动蛋白通路、基因变异、蛋白质相互作用。本站分类：眼病/眼组织缺损。本数据集为眼病领域公开数据集，主题涵盖眼病。
基本信息
资源简介
评估眼组织缺损患者变异中肌动蛋白通路相互作用
该数据集英文名为 Assessing actin-pathway interactions in variants identified in patients with ocular coloboma，归属于眼病 / 眼组织缺损分类，来源于 ebi.ac.uk。数据集围绕眼组织缺损患者中检出的基因变异，评估这些变异与肌动蛋白通路之间的相互作用，主题标签涵盖眼病、眼组织缺损、肌动蛋白通路、基因变异与蛋白质相互作用。作为眼病领域的公开数据集，其主题聚焦于眼病相关研究方向，为关注眼组织缺损分子机制的研究者提供了一个可检索、可引用的数据资源入口。以下依据可获得的信息，从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
眼组织缺损属于眼病范畴中的一类发育相关异常，其分子基础常涉及基因变异对细胞结构与信号过程的影响。肌动蛋白通路在细胞形态维持、迁移与组织发育中具有基础性作用，因此考察患者中检出的变异是否影响肌动蛋白通路相关相互作用，是理解该类疾病机制的一条研究路径。该数据集正是以“评估眼组织缺损患者中所检出变异与肌动蛋白通路的相互作用”为主题而建立，其标题直接体现了研究对象（患者变异）与研究切入点（肌动蛋白通路相互作用）之间的对应关系。数据集所属分类为眼病 / 眼组织缺损，主题标签同时包含眼病、眼组织缺损、肌动蛋白通路、基因变异与蛋白质相互作用，说明其内容定位于眼病分子机制研究，而非临床诊疗数据或流行病学统计。
【数据内容】
该数据集的主题涵盖眼病，核心内容围绕眼组织缺损患者中检出的基因变异，以及对这些变异与肌动蛋白通路相互作用的评估。主题标签所列的“基因变异”与“蛋白质相互作用”提示数据涉及变异层面的信息与相互作用层面的信息。关于数据的具体组成、文件类型、样本数量、变异位点数目、相互作用实验结果的形式与规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，源站描述中给出的引用信息为 Dominic Kurian (2025). Assessing actin-pathway interactions in variants identified in patients with ocular coloboma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005090。据此可知其发布平台为 EBI 相关数据资源，并具有可访问的项目地址。关于样本采集地点、采集时间、患者来源与伦理审批等具体信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位，该数据集适用于眼病特别是眼组织缺损相关的分子机制研究场景，例如围绕患者变异与肌动蛋白通路相互作用开展的分析与比较研究，也可作为眼病领域公开数据资源用于方法学参考与结果对照。主题标签中的蛋白质相互作用提示其可用于相互作用层面的研究讨论。关于具体的推荐分析流程或已验证的下游应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过源站给出的项目地址进行访问，使用者可依据该地址获取数据集条目信息。关于数据下载方式、文件格式说明、预处理步骤与配套分析工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为公开数据集，来源站为 ebi.ac.uk，并附有明确的引用条目。关于数据质量评估指标、完整性、批次效应、样本量限制与适用范围边界等，源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时，应使用源站描述中给出的条目：Dominic Kurian (2025). Assessing actin-pathway interactions in variants identified in patients with ocular coloboma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005090。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005090
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Dominic Kurian (2025). Assessing actin-pathway interactions in variants identified in patients with ocular coloboma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD005090
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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