Slbp功能缺失导致细胞增殖向分化转换失败、视网膜缺损及中线轴突导向缺陷数据集
该数据集包含通过正向遗传筛选获得的斑马鱼eisspalte（ele）突变体的遗传学、形态表型（如视网膜缺损、轴突导向异常）及RNA测序转录组数据，主要研究Slbp（茎环结合蛋白）功能缺失如何导致细胞无法从增殖状态向分化状态转换，进而引发视网膜发育异常和中线轴突导向缺陷的分子与细胞机制。
基本信息
资源简介
Slbp功能缺失导致细胞增殖向分化转换失败、视网膜缺损及中线轴突导向缺陷数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Abrogation of Stem Loop Binding Protein (Slbp) function leads to a failure of cells to transition from proliferation to differentiation, retinal coloboma and midline axon guidance deficits》。配套论文《Abrogation of Stem Loop Binding Protein (Slbp) function leads to a failure of cells to transition from proliferation to differentiation, retinal coloboma and midline axon guidance deficits》发表于 PLOS ONE（2019），DOI：10.1371/journal.pone.0211073。源站首次发布：2019-01-29。
【数据内容】
源站原始描述：Through forward genetic screening for mutations affecting visual system development, we identified prominent coloboma and cell-autonomous retinal neuron differentiation, lamination and retinal axon projection defects in eisspalte (ele) mutant zebrafish. Additional axonal deficits were present, most notably at midline axon commissures. Genetic mapping and cloning of the ele mutation showed that the affected gene is slbp, which encodes a conserved RNA stem-loop binding protein involved in replicat…
【数据结构与技术规格】
文件数 7 个，合计 22.64 MB。pone.0211073.s003.tif：image/tiff，3.46 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0211073。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：cell state、midline axon commissures、axon projection defects、coloboma、Genetic mapping、transition、Stem Loop Binding Protein、gene、expression、embryo。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Abrogation_of_Stem_Loop_Binding_Protein_Slbp_function_leads_to_a_failure_of_cells_to_transition_from_proliferation_to_differentiation_retinal_coloboma_and_midline_axon_guidance_deficits/7645961
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Turner, Katherine J.; Hoyle, Jacqueline; Valdivia, Leonardo E.; L. Cerveny, Kara; Hart, Wendy; Mangoli, Maryam; et al. (2019). Abrogation of Stem Loop Binding Protein (Slbp) function leads to a failure of cells to transition from proliferation to differentiation, retinal coloboma and midline axon gu…
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集源于一项针对斑马鱼视觉系统发育的遗传学研究。通过正向遗传筛选，研究人员发现了eisspalte（ele）突变体斑马鱼存在明显的视网膜缺损，以及细胞自主性的视网膜神经元分化、分层和轴突投射缺陷。此外，还观察到轴突中线交叉处的显著异常。遗传定位和克隆显示，突变基因是slbp，它编码一种参与复制依赖性组蛋白mRNA代谢的保守RNA茎环结合蛋白。在野生型胚胎中细胞已分化的阶段和位置，ele突变体胚胎的中枢神经系统细胞仍停留在细胞周期中。RNA测序分析显示，许多与神经元分化相关的基因表达下调，同时多种轴突导向相关基因的表达水平和空间定位发生改变，这些可能是特定ele表型的基础。数据集包含遗传学、表型观察和转录组学数据，主要用于研究Slbp在细胞状态转换、视网膜发育和轴突导向中的关键作用。
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