PRJNA856121:蠕形螨性睑缘炎患者眼表微生物组宏基因组分析

本研究旨在比较蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照者眼表及睑脂微生物群落的差异。主题标签:眼病、睑缘炎、蠕形螨、眼表微生物组、宏基因组、睑脂、病例对照

ena
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基因组分类眼病睑缘炎蠕形螨眼表微生物组宏基因组睑脂病例对照
PRJNA856121: Metagenomic profiling of ocular surface microbiome changes in Demodex blepharitis patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PRJNA856121:蠕形螨性睑缘炎患者眼表微生物组宏基因组分析

PRJNA856121 是一项针对眼表微生物组的宏基因组研究数据集,主题为蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照者之间眼表及睑脂微生物群落的比较。该数据集归属于眼病 / 睑缘炎分类,来源站为 ebi.ac.uk。研究的核心目标在于通过微生物群落层面的对比,揭示蠕形螨性睑缘炎状态下眼表与睑脂微生态的变化特征,为理解该疾病的微生态机制提供数据基础。数据集围绕眼病、睑缘炎、蠕形螨、眼表微生物组、宏基因组、睑脂以及病例对照等主题展开,适合从事眼表微生态、睑缘炎病因学及宏基因组分析的研究者参考使用。

【数据集背景】

蠕形螨性睑缘炎是一种与眼部微生物环境密切相关的眼病。该研究的设计出发点是比较蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照者在眼表及睑脂两个部位的微生物群落差异,从而在微生物组层面刻画疾病状态下的生态改变。研究采用病例对照的思路,将患者群体与健康人群并置比较,以便识别与疾病相关的群落结构变化。这一背景决定了数据集的核心价值在于提供眼表与睑脂微生物群落的对比性观测资料。

【数据内容】

该数据集为宏基因组 profiling 数据,覆盖眼表与睑脂两类样本部位的微生物群落信息。其内容围绕蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照之间的群落比较展开,主题涉及眼表微生物组、宏基因组、睑脂以及病例对照设计。数据集英文名称明确指向“眼表微生物组变化”的宏基因组分析。除上述范围性描述外,关于样本数量、测序深度、具体物种组成或差异分析结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。研究样本取自人类的眼表与睑脂部位,用于比较蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照者的微生物群落。源站描述表明,研究目的是比较患病个体与健康对照的眼表及睑脂微生物群落。关于具体的采样方法、采样时间、样本处理流程与伦理审批信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于眼表微生态与睑缘炎相关的研究场景,包括蠕形螨性睑缘炎患者与健康人群眼表及睑脂微生物群落的对比分析、宏基因组数据的再分析,以及围绕眼病、睑缘炎、蠕形螨、眼表微生物组、睑脂与病例对照设计等主题的探索性研究。研究者可将其作为眼表微生物组比较研究的参考数据资源。

【使用方法】

该数据集为宏基因组 profiling 数据,使用时应围绕眼表与睑脂两类样本、患者与对照两组人群的比较框架进行组织。具体的分析流程、数据格式、文件组织方式与访问途径,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为病例对照设计下的宏基因组研究数据,其比较范围限定于眼表与睑脂微生物群落。关于样本量、测序质量、批次效应、混杂因素控制以及数据完整性等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合源站描述所界定的研究目标理解其适用范围。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。关于具体的引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA856121

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在比较蠕形螨性睑缘炎患者与健康对照者眼表及睑脂微生物群落的差异。

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