94例嗜铬细胞瘤/副神经节瘤多组学分析数据集
该数据集是一个多组学医学数据集,包含来自79名患者的94例嗜铬细胞瘤/副神经节瘤的基因组、转录组、表观基因组和单细胞测序数据,具体模态包括全基因组测序、全转录组测序、小RNA测序、DNA甲基化谱以及单核RNA-seq和ATAC-seq,主要用于肿瘤多组学整合分析、疾病分子分型、驱动基因鉴定以及生物标志物发现等研究方向。

基本信息
资源简介
该数据集包含对来自79名患者的94例嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(PCPG)进行多组学分析产生的体细胞(非可识别)数据。数据通过六种分子方法生成,包括:肿瘤及匹配血液的全基因组测序(WGS, n=94)、全转录组测序(RNA-seq, n=91)、小RNA测序(small-RNA-seq, n=90)、DNA甲基化谱分析(n=93),并对9例和7例病例分别应用了基于液滴的单核RNA-seq(snRNA-seq)和单核ATAC-seq(snATAC-seq)。数据集内容涵盖WGS的拷贝数谱、体细胞变异、结构变异和端粒定量;Illumina EPIC芯片的甲基化β值;小RNA-seq和RNA-seq的标准化表达量与原始计数;单核ATAC-seq和RNA-seq的片段矩阵与特征计数矩阵;以及整合了外部数据(如TCGA)的甲基化、转录组和小RNA的合并数据集。该数据集主要用于肿瘤基因组学、多组学整合分析、嗜铬细胞瘤/副神经节瘤的分子机制与生物标志物研究。
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源站:https://figshare.com/articles/dataset/Multi-omic_analysis_of_94_PCPG/25792479/2
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数据说明
该数据集包含对来自79名患者的94例嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(PCPG)进行多组学分析产生的体细胞(非可识别)数据。数据通过六种分子方法生成,包括:肿瘤及匹配血液的全基因组测序(WGS, n=94)、全转录组测序(RNA-seq, n=91)、小RNA测序(small-RNA-seq, n=90)、DNA甲基化谱分析(n=93),并对9例和7例病例分别应用了基于液滴的单核RNA-seq(snRNA-seq)和单核ATAC-seq(snATAC-seq)。数据集内容涵盖WGS的拷贝数谱、体细胞变异、结构变异和端粒定量;Illumina EPIC芯片的甲基化β值;小RNA-seq和RNA-seq的标准化表达量与原始计数;单核ATAC-seq和RNA-seq的片段矩阵与特征计数矩阵;以及整合了外部数据(如TCGA)的甲基化、转录组和小RNA的合并数据集。该数据集主要用于肿瘤基因组学、多组学整合分析、嗜铬细胞瘤/副神经节瘤的分子机制与生物标志物研究。
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