HABC研究内脏脂肪全基因组关联研究

数据覆盖纵向与横断面设计,属于内分泌系统疾病/肥胖症领域。可用于探索与内脏脂肪相关的遗传变异,支持肥胖症遗传机制研究,并可能用于构建预测模型或回归分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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时间序列回归Longitudinal, Cross-Sectional
phs000169: Whole Genome Association Study of Visceral Adiposity in the HABC Study

基本信息

模态
时间序列
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

HABC研究内脏脂肪全基因组关联研究

phs000169 是一项围绕内脏脂肪开展的全体基因组关联研究,隶属于 HABC 研究框架,可在 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台获取。该数据集在分类上归属于内分泌系统疾病与肥胖症方向,主题标签涵盖纵向与横断面两种研究设计。整体来看,它面向与内脏脂肪相关的遗传变异探索,服务于肥胖症遗传机制研究,并可能用于构建预测模型或开展回归分析。数据来源为 dbGaP 研究,兼具纵向随访与横断面观察的特征,为研究内脏脂肪这一肥胖症核心表型的遗传基础提供了数据支撑。

【数据集背景】

该数据集的全称为 Whole Genome Association Study of Visceral Adiposity in the HABC Study,属于内分泌系统疾病与肥胖症领域。其研究焦点是内脏脂肪这一表型,并采用全体基因组关联研究的思路,试图从遗传层面理解内脏脂肪的分布与变化。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP 平台,该平台为基因型与表型关联研究提供数据存储与分发。主题标签显示其设计同时包含纵向与横断面两种类型,意味着研究既关注随时间推移的随访观察,也关注某一时点上的横断面特征。

【数据内容】

数据集覆盖纵向与横断面设计,属于内分泌系统疾病与肥胖症领域。其内容围绕内脏脂肪相关的遗传变异展开,可用于探索与内脏脂肪相关的遗传信号,支持肥胖症遗传机制研究。数据可能用于构建预测模型或回归分析。关于具体的样本量、位点数量、表型字段、随访次数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study,研究设计标注为 Longitudinal, Cross-Sectional。除此之外,关于采集地点、采集时间、纳入排除标准、样本来源人群等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于探索与内脏脂肪相关的遗传变异,支持肥胖症遗传机制研究,并可能用于构建预测模型或回归分析。由于同时具备纵向与横断面设计特征,它可用于需要结合时间维度与横断面比较的分析场景。关于更具体的适用场景,如特定人群、特定统计方法或特定临床终点,源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,包括数据申请流程、访问权限、下载方式、分析工具或配套文档等,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的质量评估、数据完整性、缺失情况、偏倚控制或已知限制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用要求、许可条款、使用限制或数据共享政策等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000169

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Longitudinal, Cross-Sectional).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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