电针模拟运动诱导的多囊卵巢综合征女性骨骼肌基因表达变化
该数据集来自 search.dataone.org,属于内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症分类,聚焦电针干预下胰岛素抵抗的超重/肥胖女性骨骼肌分子机制

基本信息
资源简介
电针模拟运动诱导的多囊卵巢综合征女性骨骼肌基因表达变化
Electroacupuncture mimics exercise-induced changes in skeletal muscle gene expression in women with polycystic ovary syndrome
该数据集来自 search.dataone.org,属于内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症分类,聚焦电针干预下胰岛素抵抗的超重/肥胖女性骨骼肌分子机制。研究采用病例对照设计,纳入 15 名多囊卵巢综合征(PCOS)女性和 14 名对照,在电针前后采集骨骼肌活检,使用 Illumina BeadChips 芯片分析基因表达与甲基化。转录组分析发现 180 个独特基因表达受电针改变(q < 0.05)。数据可用于探索电针诱导葡萄糖摄取的转录组与表观遗传变化,以及 PCOS 相关代谢异常的分子研究(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:自主神经系统激活介导了电针引起的全身葡萄糖摄取增加,但其机制在很大程度上尚不清楚。目的:识别电针诱导骨骼肌葡萄糖摄取在胰岛素抵抗的超重/肥胖女性(伴或不伴多囊卵巢综合征(PCOS))中的分子机制。设计/参与者:在一项病例对照研究中,从 15 名 PCOS 女性和 14 名对照中采集电针前后的骨骼肌活检。使用 Illumina BeadChips 阵列分析基因表达和甲基化。结果:单次电针可恢复骨骼肌的代谢和转录改变,并诱导表观遗传变化。转录组分析显示 180 个独特基因(q < 0.05)的表达被电针改变,其中 95% 的 t
【主题与分类】
主题标签:gene expression、Polycystic ovary syndrome (PCOS)、acupuncture、electroacupuncture。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A6c6b8a08e520c8ffc6754556a91034f19e1ac7afc94d704c63599b55c958099b
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景:自主神经系统激活介导了电针引起的全身葡萄糖摄取增加,但其机制在很大程度上仍不清楚。目的:在伴有和不伴多囊卵巢综合征(PCOS)的胰岛素抵抗超重/肥胖女性中,识别电针诱导骨骼肌葡萄糖摄取所涉及的分子机制。设计/参与者:在一项病例对照研究中,于电针前后从15名PCOS女性和14名对照者采集骨骼肌活检样本。使用Illumina BeadChips芯片分析基因表达和甲基化。结果:单次电针可恢复代谢和转录改变,并诱导骨骼肌的表观遗传变化。转录组分析显示,电针改变了180个独特基因的表达(q < 0.05),其中95%的变化趋向更健康的表型。我们在304个独特位点识别出DNA甲基化变化(q < 0.20),这些变化与101个基因的表达改变相关(p < 0.05)。
在电针应答中上调最显著的50个基因里,有38%也因运动而上调。我们鉴定出一组在患PCOS的女性中被电针选择性改变的基因。例如,MSX1和SRNX1在PCOS女性肌肉组织中表达降低,而电针和运动可使其表达增加。在培养的肌管中,通过siRNA介导沉默这两个基因会减少糖原合成,这支持了这些基因在葡萄糖稳态中的作用。结论:我们的发现提供了证据,表明电针能以类似于急性运动的方式使骨骼肌中的基因表达正常化。因此,电针可能是帮助那些难以进行运动的人的一种有用方法。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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