PDK2与ADHFE1与肥胖脂肪组织丙酮酸代谢及免疫重塑关联的多数据集转录组整合分析数据
肥胖发生于基因-环境相互作用扰乱体重中枢调节之时。尽管丙酮酸代谢改变已被认为与肥胖相关，但将该通路与疾病联系起来的机制仍未被完全阐明
基本信息
资源简介
PDK2与ADHFE1与肥胖脂肪组织丙酮酸代谢及免疫重塑关联的多数据集转录组整合分析数据
该数据集为一项关于肥胖脂肪组织转录组学研究的分析结果，英文名称为“Data analysis result of Article: PDK2 and ADHFE1 are associated with pyruvate metabolism and immune remodeling in obese adipose tissue:an integrative multi-dataset transcriptomic study”。研究围绕肥胖发生过程中基因-环境相互作用扰乱体重中枢调节这一背景展开，关注丙酮酸代谢改变与肥胖之间的关联，并尝试阐明将该通路与疾病联系起来的机制。作者建立了整合性系统生物学工作流程，结合人脂肪组织数据集的批量转录组分析、两种机器学习算法以及人样本的单细胞RNA测序，以识别与丙酮酸代谢相关的肥胖相关生物标志物。该数据集由Gong, Yingying提交至Zenodo，发布时间为2026年，采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，本站归类于内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症方向。
【数据集背景】
肥胖的发生与基因-环境相互作用对体重中枢调节的干扰密切相关。尽管丙酮酸代谢的改变已被认为与肥胖相关，但将该通路与疾病联系起来的机制仍未被完全阐明。为深入探究这一机制，相关研究建立了整合性系统生物学工作流程，旨在从多数据集转录组层面识别与丙酮酸代谢相关的肥胖相关生物标志物，本数据集即为该研究的分析结果。
【数据内容】
该数据集为上述文章的分析结果，内容对应一项整合多数据集转录组研究。研究聚焦于PDK2与ADHFE1两个分子，二者与肥胖脂肪组织中的丙酮酸代谢及免疫重塑相关。分析工作整合了人脂肪组织数据集的批量转录组分析、两种机器学习算法以及人样本的单细胞RNA测序结果，用于识别与丙酮酸代谢相关的肥胖相关生物标志物。关于数据集的具体文件构成、变量字段与记录数量，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于人脂肪组织数据集及人样本的单细胞RNA测序数据，经整合性系统生物学工作流程分析后形成本数据集。数据由作者Gong, Yingying提交，机构为Zenodo，来源站为doi.org，发布时间为2026年。关于样本采集地点、采集时间、样本量及具体测序平台等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肥胖症相关的基础与转化研究，尤其是围绕丙酮酸代谢通路与肥胖脂肪组织免疫重塑之间关联的探索。可用于支持与PDK2、ADHFE1相关的生物标志物研究，也可为采用批量转录组分析、机器学习算法与单细胞RNA测序相结合的多数据集整合分析提供参考。关于其在临床诊断、药物开发等具体应用中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为文章分析结果，使用时应结合原始研究的方法学描述理解其分析流程，包括批量转录组分析、两种机器学习算法及单细胞RNA测序的整合应用。关于数据文件的具体格式、读取方式、分析代码及复现步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于整合性多数据集转录组分析流程产生，其结果依赖于所纳入的人脂肪组织数据集与人样本单细胞RNA测序数据。关于数据集的准确性评估、批次效应处理、样本代表性及验证情况等质量信息，源站未提供；关于研究结论的普适性与局限性，源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时应引用作者Gong, Yingying的相关研究，数据集英文名称见前述。该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可，允许在署名条件下使用与共享。关于具体引用格式与署名要求，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23499317
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 73.7 KB。
数据说明
肥胖是在基因-环境相互作用扰乱体重中枢调节时发生的。尽管丙酮酸代谢改变已被认为与肥胖相关，但将该通路与疾病联系起来的机制仍未被完全阐明。我们建立了一套整合的系统生物学工作流程，该流程结合了人类脂肪组织数据集的批量转录组分析、两种机器学习算法以及人类样本的单细胞RNA测序（scRNA-seq），以识别与丙酮酸代谢相关的肥胖相关生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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