GSE174478日本NAFLD转录组队列
NAFLD/NASH肝组织RNA测序
基本信息
资源简介
GSE174478日本NAFLD转录组队列
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole transcriptome profiling of Japanese nonalcoholic fatty liver disease cohort.》。源站首次发布：May 14 202。
【数据内容】
源站原始描述：Nonalcoholic steatohepatitis (NASH) is a severe form of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) that is characterized by hepatic steatosis, inflammation, hepatocellular injury, and fibrosis, which lead to progressed cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Despite its increasing prevalence on a global scale, the pathogenesis of NASH progression is not well understood. To elucidate the underlying mechanisms of NASH progression, we conducted transcriptome analyses of Japanese NAFLD cohort in our f…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174478
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 20 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE174478
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
94例活检证实NAFLD患者肝组织RNA测序数据，覆盖NASH进展相关转录组特征。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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