基于生物信息学分析探索肥胖与非酒精性脂肪性肝炎的共发病机制数据集
该数据集整合了来自GEO数据库的肥胖与非酒精性脂肪性肝炎相关基因表达芯片数据，包含差异基因分析、WGCNA网络构建、GO/KEGG富集分析以及蛋白质相互作用网络等生物信息学分析结果，主要数据模态为基因表达谱和临床关联数据。它通过筛选关键基因（如VCAN和IL1RN）并分析其与免疫细胞的关联，旨在探索OB和NASH的共发病机制，为这两种疾病的靶向诊断与治疗研究提供数据支持和理论基础。
创建时间2025-01-26
更新时间2025-02-05
原始链接
https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=OA_dea7b4ec94d4426aa7e4cec2e6231d80
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资源简介
该数据集旨在通过生物信息学方法研究肥胖（OB）与非酒精性脂肪性肝炎（NASH）的发病机制、疾病特征基因及免疫浸润表现，并探讨疾病特征基因与免疫细胞之间的相关性。数据来源于GEO数据库中的OB和NASH相关芯片（包括GSE25401、GSE151839、GSE63067和GSE89632），通过R语言进行差异基因分析和WGCNA分析，利用GO和KEGG富集分析进行功能注释，并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用12种cytohubba方法筛选关键基因（如IL6、IL1B、IL1RN、VCAN和TNFAIP6），并通过ROC曲线和样本芯片验证其准确性，最终确定VCAN和IL1RN为性能最佳的疾病特征基因。此外，采用CIBERSORT算法分析OB和NASH的免疫浸润情况，揭示了疾病特征基因与免疫细胞之间的显著相关性。该数据集为肥胖和NASH的靶向诊断与治疗研究提供了初步的生物信息学基础。
提供机构：LIkun.DU; Jiarui.Li; Siwei.Wang
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