GSE65529:散发性及遗传性(MEN1)胰腺内分泌肿瘤长链非编码RNA表达谱

MEN1遗传性胰腺肿瘤lncRNA数据集

University Hospital UppsalaUniversity Hospital Uppsala
NCBI Gene Expression Omnibus
2016-03-11 更新
浏览 41
文本分类GPL1702110090
GSE65529: Long non-coding RNA expression profiling of sporadic and hereditary (MEN1) pancreatic endocrine tumors

基本信息

模态
文本
大小
0.05 GB
数据量
30
任务类型
分类
许可
Open Data Commons
创建/更新时间
2016-03-11

资源简介

GSE65529:散发性及遗传性(MEN1)胰腺内分泌肿瘤长链非编码RNA表达谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Single cell analysis of macrophages exposed to beads coated with LPS from Salmonella enterica subsp. typhimurium》。源站首次发布:Feb 02 201。

【数据内容】

源站原始描述:We present a detailed single cell analysis of the macrophage response to LPS from Salmonella enterica. By combining single cell transcriptional analysis, fluorescently labeled, LPS-coated beads, and cytometry we are able to distinguish the responses of macrophages that have internalized LPS-coated beads and those that have not

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL17021、10090。

【适用方向】

文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65529

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE65529

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.05 GB。

数据说明

此数据集利用定制芯片探讨了lncRNA在MEN1和散发性胰腺内分泌肿瘤中的表达图谱,旨在挖掘受MEN1/Menin蛋白复合物直接或间接调控的非编码RNA分子标志物。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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