新型ANOS1变异致家族性Kallmann综合征基因表达谱
该数据集为RNA-seq全血转录组数据,来源于X连锁家族性Kallmann综合征患者,该家系携带ANOS1基因新变异(c.452G>C)

基本信息
资源简介
新型ANOS1变异致家族性Kallmann综合征基因表达谱
Gene expression profiling of familial Kallmann syndrome caused by a novel ANOS1 variant
该数据集为RNA-seq全血转录组数据,来源于X连锁家族性Kallmann综合征患者,该家系携带ANOS1基因新变异(c.452G>C)。样本包括两名患病男性同胞、其母亲及对照。数据可用于分析ANOS1相关Kallmann综合征的基因表达与剪接模式,为研究性腺功能减退症中的转录组改变提供资源(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该RNA-seq数据集包含与ANOS1基因新变异(c.452G>C)相关的X连锁家族性Kallmann综合征个体的全血转录组图谱。样本采集自两名患病男性同胞、他们的母亲和对照。从全血中提取总RNA,并在使用KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase进行文库制备前去除核糖体RNA。在Illumina NovaSeq X Plus平台上进行双端RNA测序,每个样本产生约1亿条双端读长。测序使用了10B、300循环流动池的1%,该流动池每个可产生多达200亿条双端读长。该数据集可用于全面分析与ANOS1相关Kallmann综合征相关的基因表达和剪接模式,为研究性腺功能减退症中的转录组改变提供宝贵资源。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:内分泌系统疾病/男性性腺功能减退症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318901
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 16 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
该RNA-seq数据集包含与ANOS1基因新变异(c.452G>C)相关的X连锁家族性Kallmann综合征个体的全血转录组图谱。样本采集自两名患病的男性同胞、他们的母亲以及对照组。从全血中提取总RNA,并在文库制备前使用KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase去除核糖体RNA。在Illumina NovaSeq X Plus平台上进行双端RNA测序,每个样本产生约1亿条双端读段。测序使用了10B、300循环流动池的1%,该流动池每个流动池最多可产生200亿条双端读段。该数据集能够全面分析与ANOS1相关Kallmann综合征相关的基因表达和剪接模式,为研究低促性腺激素性性腺功能减退症中的转录组改变提供了宝贵资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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