Gitelman和Bartter综合征遗传性低钾血症突变数据集

该数据集汇总了罕见内分泌和肾脏疾病(Gitelman综合征和Bartter综合征)引起的常染色体隐性遗传性低钾血症患者的基因突变位点信息(如SLC12A3, KCNJ1等基因),适用于致病突变分类研究。由ClinVar / NCBI提供,来自ClinVar,数据格式为文本,包含840条数据记录,许可证为Open Data Commons。

ClinVar / NCBIClinVar / NCBI
ClinVar
2024-03-01 更新
浏览 28
文本分类genomic variationhuman healthdiseasesdrug responsesclinical testing labsresearch labsgenetics clinicspatient registrieslocus-specific databasesexpert panelspractice guidelines
Gitelman and Bartter Syndrome Genetic Hypokalemia Variant Dataset

基本信息

模态
文本
大小
0.8 GB
数据量
840
任务类型
分类
许可
Open Data Commons
创建/更新时间
2024-03-01

资源简介

Gitelman和Bartter综合征遗传性低钾血症突变数据集

【一句话概览】

ClinVar 汇总基因组变异及其与人类健康关系的信息,是一个可免费访问的公开档案库,收录针对疾病和药物反应分类的人类变异报告及支持证据。其标签涵盖基因组变异、人类健康、疾病、药物反应,以及临床检测实验室、研究实验室、遗传学诊所、患者登记处、位点特异性数据库、专家小组和实践指南(来源 NCBI)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《ClinVar》。

【数据内容】

源站原始描述:ClinVar aggregates information about genomic variation and its relationship to human health. ClinVar is a freely accessible, public archive of reports of human variations classified for diseases and drug responses, with supporting evidence

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):ClinVar汇集了关于基因组变异及其与人类健康关系的信息。它是一个可免费访问的公共档案库,收录了针对疾病和药物反应分类的人类变异报告,并附有支持性证据。

【主题与分类】

主题标签:genomic variation、human health、diseases、drug responses、clinical testing labs、research labs、genetics clinics、patient registries、locus-specific databases、expert panels。

【适用方向】

文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.80 GB。

数据说明

该数据集汇总了罕见内分泌和肾脏疾病(Gitelman综合征和Bartter综合征)引起的常染色体隐性遗传性低钾血症患者的基因突变位点信息(如SLC12A3, KCNJ1等基因),适用于致病突变分类研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案