原发性醛固酮增多症导致低钾血症的基因表达数据集

该数据集来自基因表达综合数据库(GEO),编号为 GSE167851。由National Center for Biotechnology Information提供,来自GEO (Gene Expression Omnibus),数据格式为文本,包含42条数据记录,适用于分类任务,许可证为Open Data Commons。

National Center for Biotechnology InformationNational Center for Biotechnology Information
GEO (Gene Expression Omnibus)
2022-11-15 更新
浏览 36
文本分类GPL203019606
Gene Expression in Primary Aldosteronism with Hypokalemia

基本信息

模态
文本
大小
0.45 GB
数据量
42
任务类型
分类
许可
Open Data Commons
创建/更新时间
2022-11-15

资源简介

原发性醛固酮增多症导致低钾血症的基因表达数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Control ChIP-seq from RWPE2 (ENCSR753IXW)》。源站首次发布:Feb 26 202。

【数据内容】

源站原始描述:ChIP-seq on human RWPE2

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing、GPL20301、9606。

【适用方向】

文本类数据可用于医学自然语言处理,如命名实体识别、信息抽取与文本分类。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167851

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 01 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167851

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 0.45 GB。

数据说明

该数据集来自基因表达综合数据库(GEO),编号为 GSE167851。研究了原发性醛固酮增多症(引起低钾血症的内分泌核心疾病)患者肾上腺皮质组织的RNA测序数据,旨在探索导致严重低钾血症的分子生物学机制。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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