溶酶体酶与单基因代谢靶点(SMN1、GBA、HEXA、G6PD、GAA、GLA)的精细坐标结构与口袋分析数据集

本数据集聚焦溶酶体酶与单基因代谢靶点(SMN1、GBA、HEXA、G6PD、GAA、GLA),提供精细坐标结构与口袋分析结果

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基因组预测ACE2BYCCCFTRCRC32DMDDPP4F8F9G6PDGAAGBA
Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Lysosomal Enzymes and Monogenic Metabolic Targets (SMN1, GBA, HEXA, G6PD, GAA, GLA)

基本信息

模态
基因组
大小
0.000501352 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-13
版本
v1.1-nrc-restored

资源简介

溶酶体酶与单基因代谢靶点(SMN1、GBA、HEXA、G6PD、GAA、GLA)的精细坐标结构与口袋分析数据集

Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Lysosomal Enzymes and Monogenic Metabolic Targets (SMN1, GBA, HEXA, G6PD, GAA, GLA)

本数据集聚焦溶酶体酶与单基因代谢靶点(SMN1、GBA、HEXA、G6PD、GAA、GLA),提供精细坐标结构与口袋分析结果。源站描述以SMN1、GBA、HEXA为例,给出基于ESMFold-V2的构象稳定性指标(pLDDT、发育稳定性指数)和基于BioNeMo的药代动力学参数(LogD、儿科缩放因子、代谢清除率、就绪评分),并标注完整性溯源信息。数据可用于罕见儿科与先天性疾病相关靶点的结构稳定性评估、药代性质预测及成药性分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):临床治疗规范:第10批:罕见儿科与先天性疾病 标准:GLP对齐/制药级 靶点:SMN1 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:89.4 - 发育稳定性指数:0.92 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 靶点:GBA 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:86.7 - 发育稳定性指数:0.85 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 靶点:HEXA 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:84.2 - 发育稳定性指数:0.85 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 完整性与溯源:坐标与分析

【主题与分类】

主题标签:ACE2、BY、CC、CFTR、CRC32、DMD、DPP4、F8、F9、G6PD。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22994394

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 501.4 KB。

数据说明

临床治疗规范:第10批:罕见儿科与先天性疾病 标准:符合GLP / 制药级 ## 靶点:SMN1 ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:89.4 - 发育稳定性指数:0.92 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 ## 靶点:GBA ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:86.7 - 发育稳定性指数:0.85 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 ## 靶点:HEXA ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:84.2 - 发育稳定性指数:0.85 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.85 - 儿科缩放因子:0.75 - 代谢清除率:正常 - 就绪评分:0.94 完整性与来源:坐标和分析带有可通过CRC32/MD5验证的清单;TTT-7审计标记仅为组织约定。 许可:CC BY 4.0——开放用于学术和商业治疗用途。

首席研究员:James Paul Trageser
所属机构:Nexus Resonance Codex
ORCID:0009-0006-6678-2908
X(Twitter):@jtrag
代码库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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