大鼠甲状旁腺 LC-MS/MS 数据集

主题标签:甲状旁腺、LC-MS/MS、大鼠、蛋白质组学、内分泌。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/其他。本数据集为内分泌、营养和代谢疾病领域公开数据集,主题涵盖甲状旁腺。

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蛋白质甲状旁腺LC-MS/MS大鼠蛋白质组学内分泌
Rat parathyroid glands LC-MS/MS

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-11-11

资源简介

大鼠甲状旁腺 LC-MS/MS 数据集

Rat parathyroid glands LC-MS/MS 是一个以内分泌、营养和代谢疾病为分类归属的公开数据集,主题聚焦于大鼠甲状旁腺,采用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术路线,属于蛋白质组学范畴。该数据集由 Iddo Ben-Dov 于 2022 年发布,收录于 EBI(欧洲生物信息研究所)平台,可通过其在 PRIDE 归档中的项目编号 PXD029368 访问。从主题构成看,该数据集同时关联甲状旁腺、LC-MS/MS、大鼠、蛋白质组学与内分泌等关键词,面向的是内分泌系统中甲状旁腺相关蛋白质组成分的研究需求。整体而言,它是一个以质谱技术为支撑、以模式动物甲状旁腺组织为对象的内分泌蛋白质组学公开数据资源,可供相关领域研究者检索与使用。

【数据集背景】

甲状旁腺是内分泌系统的重要腺体,其功能与钙磷代谢调节密切相关,相关疾病在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病。在蛋白质组学研究中,大鼠是常用的模式动物之一,针对其甲状旁腺组织开展质谱分析,有助于在蛋白质层面刻画该腺体的分子组成。该数据集正是在这一研究背景下产生,由 Iddo Ben-Dov 于 2022 年发布,主题标签涵盖甲状旁腺、LC-MS/MS、大鼠、蛋白质组学与内分泌,体现了内分泌学与蛋白质组学交叉的研究定位。数据集在分类体系中归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”,说明其应用方向与内分泌及代谢相关疾病的研究领域相联系。

【数据内容】

该数据集的主题内容为大鼠甲状旁腺的 LC-MS/MS 数据,即通过液相色谱-串联质谱技术获得的蛋白质组学数据。主题标签明确包含“甲状旁腺”“LC-MS/MS”“大鼠”“蛋白质组学”“内分泌”,表明数据对象为大鼠甲状旁腺组织,数据类型为质谱蛋白质组学数据。关于数据的具体规模,例如样本数量、鉴定到的蛋白质数目、质谱运行次数、原始文件数量与格式等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体为 EBI 平台 PRIDE 归档中的项目 PXD029368,发布者为 Iddo Ben-Dov,发布年份为 2022 年。数据采用 LC-MS/MS 技术采集,研究对象为大鼠甲状旁腺。关于样本制备流程、质谱仪器型号、色谱条件、实验设计细节等采集层面的具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题构成,该数据集适用于内分泌、营养和代谢疾病领域中以甲状旁腺为对象的研究场景,尤其是需要在蛋白质组层面考察大鼠甲状旁腺分子组成的分析工作。LC-MS/MS 蛋白质组学数据的通用用途包括蛋白质鉴定与定量分析、不同样本或组别间的蛋白质表达比较,以及作为相关研究的参考数据或验证依据。该数据集亦可服务于内分泌学与蛋白质组学交叉方向的方法学参考与数据再利用。关于该数据集已被用于哪些具体研究或产生了哪些具体结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 PRIDE 归档项目 PXD029368 的形式发布,使用者可通过 EBI 平台的相关项目页面获取数据。关于数据的具体文件构成、下载方式、检索接口、配套分析工具与处理流程等使用层面的信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI 平台公开归档的蛋白质组学数据集,发布者为 Iddo Ben-Dov,发布年份为 2022 年。关于数据质量评价指标、缺失值情况、技术重复与生物学重复设置、鉴定置信度阈值等质量相关信息,源站未提供。使用者在再利用时应注意,该数据集的对象为大鼠甲状旁腺,其结论向其他物种或其他组织的推广需谨慎对待;具体的技术限制说明源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Iddo Ben-Dov (2022). Rat parathyroid glands LC-MS/MS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029368。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029368

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Iddo Ben-Dov (2022). Rat parathyroid glands LC-MS/MS [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029368

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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