单剂量阿苯达唑治疗对加纳钩虫感染者肠道微生物组的影响
该数据集来自一项2018至2021年在加纳Kintampo North Municipality开展的纵向研究，包含钩虫感染者在单剂量400 mg阿苯达唑治疗前后采集的粪便样本16S rRNA扩增子测序原始序列数据
基本信息
资源简介
单剂量阿苯达唑治疗对加纳钩虫感染者肠道微生物组的影响
该数据集来自一项2018至2021年在加纳Kintampo North Municipality开展的纵向研究，包含钩虫感染者在单剂量400 mg阿苯达唑治疗前后采集的粪便样本16S rRNA扩增子测序原始序列数据。数据覆盖治疗前及治疗后10-14天两个时间点，涉及治疗后治愈与仍感染两类参与者，可用于分析钩虫感染与肠道微生物组组成及生物多样性的关联，并识别与治疗结局相关的潜在微生物标志物（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：微生物在人体肠道稳态、代谢、免疫及机体病理生理中发挥重要作用。2018-2021年在加纳Kintampo North Municipality开展的一项纵向研究显示，部分社区采用单剂量400 mg阿苯达唑治疗后，钩虫感染治愈率较低。为探究钩虫感染与肠道微生物组之间的关联，我们检测了知情同意参与者中治疗后治愈或仍感染者的粪便样本。在每个时间点，对感染者于阿苯达唑治疗前及治疗后10-14天采集粪便样本。我们对粪便样本提取的DNA进行16S rRNA扩增子测序，以研究肠道微生物群的组成和生物多样性，并识别与治疗结局相关的潜在微生物标志物。该数据集包含
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA923309
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA923309
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
微生物在人体肠道稳态、代谢、免疫及机体病理生理过程中发挥着重要作用。2018-2021年在加纳金坦波北市区开展的一项纵向研究表明，在一些社区中，单剂量400 mg阿苯达唑治疗后钩虫感染的治愈率较低。为探究钩虫感染与肠道微生物组之间的关联，我们检测了知情同意参与者中经治疗后治愈或仍未治愈者的粪便样本。在每个时间点，对感染者分别在阿苯达唑治疗前和治疗后10-14天采集粪便样本。我们对粪便样本提取的DNA进行16S rRNA扩增子测序，以研究肠道微生物群的组成和生物多样性，并识别与治疗结局相关的潜在微生物生物标志物。本数据集包含细菌16S基因序列reads，其引物和条形码已从V3-V4高变区扩增产物中预先修剪，按照标准Illumina测序方案在NovaSeq 6000 Illumina平台上完成测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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