PRJNA767615:部分雄激素不敏感综合征关键基因鉴定与诊断价值生物信息学分析

该数据集来自 NCBI,属于内分泌、营养和代谢疾病及其他类别,主题标签为 Raw sequence reads。研究采集部分性雄激素不敏感综合征(PAIS)患者与健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs),进行 RNA-seq 以分析转录组差异,并开展组织特异性基因表达、功能富集和蛋白-蛋白相互作用(

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA767615: Identification of Crucial Genes in Pathogenesis and Diagnostic Value Analysis of Partial Androgen Insensitivity Syndrome Using Bioinformatics Analysis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA767615:部分雄激素不敏感综合征关键基因鉴定与诊断价值生物信息学分析

该数据集来自 NCBI,属于内分泌、营养和代谢疾病及其他类别,主题标签为 Raw sequence reads。研究采集部分性雄激素不敏感综合征(PAIS)患者与健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs),进行 RNA-seq 以分析转录组差异,并开展组织特异性基因表达、功能富集和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析,识别关键模块,最后用 qRT-PCR 验证候选差异表达基因。数据共捕获 725 个差异表达基因(DEGs),可用于探索 PAIS 的发病机制与诊断标志物(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:雄激素不敏感综合征(AIS)是一种罕见的 X 连锁遗传病,也是 46, XY 性发育障碍的原因之一。由于临床表型重叠,AIS 的诊断并不直观,性别分配的困境仍困扰着该疾病。方法:分离部分性 AIS 患者和健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs),进行 RNA-seq 以研究转录组差异。随后进行组织特异性基因表达、功能富集和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析,并鉴定关键模块。最后,通过 qRT-PCR 在 PAIS 患者和健康对照者的 PBMCs 中验证感兴趣差异表达基因的 RNA 表达。结果:在我们的数据集中,共捕获 725 个差异表达基因(DEGs)。功能富集的结果

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA767615

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景:雄激素不敏感综合征(AIS)是一种罕见的X连锁遗传病,也是46,XY性发育障碍的病因之一。由于临床表型重叠,AIS的诊断并不直观,且性别分配的困境仍然困扰着该疾病。方法:分离部分性AIS患者和健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs),进行RNA-seq以探究转录组差异。随后,进行组织特异性基因表达、功能富集和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,并鉴定关键模块。最后,通过qRT-PCR在PAIS患者和健康对照者的PBMCs中验证感兴趣差异表达基因的RNA表达。结果:在我们的数据集中,共捕获725个差异表达基因(DEGs)。功能富集分析结果表明,这些基因在生殖和免疫相关通路及GO功能中显著富集。

这与以血液/免疫和生殖/内分泌为中心的最具特异性系统的DEGs组织特异性基因表达分析结果一致。我们最终通过PPI网络的关键基因簇和组织特异性基因表达的人工筛选,过滤出CCR1、PPBP、PF4、CLU、KMT2D、GP6和SPARC。这些新基因有助于深入了解AIS在免疫或代谢方面的发病机制。此外,涉及男性化不足的结果为临床筛查提供了可能的分子标志物。qRT-PCR结果显示,PAIS患者和健康对照中的表达水平趋势与生物信息学分析结果一致。结论:本研究阐明了AIS发病和进展的分子机制,并提供了诊断和治疗的候选靶点。然而,进一步研究其关系仍需

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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