PRJNA1536700：ACOX1 过表达滑膜成纤维细胞转录组分析
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1536700），主题为 ACOX1 过表达条件下滑膜成纤维细胞的转录组分析，数据类型为原始序列读长（Raw sequence reads）
基本信息
资源简介
PRJNA1536700：ACOX1 过表达滑膜成纤维细胞转录组分析
该数据集为 NCBI BioProject 数据库中的一项转录组研究项目，编号为 PRJNA1536700，英文标题为“Transcriptome profiling of synovial fibroblasts with ACOX1 overexpression”。从标题可以看出，该项目聚焦于在 ACOX1 过表达条件下对滑膜成纤维细胞进行转录组层面的分析，属于基因表达谱研究范畴。数据以原始序列读长（Raw sequence reads）的形式呈现，用户可通过 NCBI 的 BioProject 记录入口获取该项目的相关数据链接。本站将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类，提示该研究可能与代谢相关疾病背景下的滑膜组织病理机制存在关联。整体而言，这是一个依托 NCBI 公共平台发布、围绕特定基因干预与特定细胞类型展开的转录组测序项目。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种类型生物学数据。该项目通常由单一机构或联合体发起，BioProject 记录本身为用户提供一个集中入口，以便查找由该项目产生的各类数据。PRJNA1536700 即属于此类项目记录，其研究主题为 ACOX1 过表达条件下滑膜成纤维细胞的转录组分析。滑膜成纤维细胞是关节滑膜组织中的主要细胞类型之一，在关节炎症和软骨破坏等过程中可能发挥重要作用；ACOX1 是参与过氧化物酶体脂肪酸氧化途径的基因。该数据集将 ACOX1 过表达与滑膜成纤维细胞的转录组变化联系起来，为研究该基因在滑膜细胞中的功能提供了序列数据基础。
【数据内容】
该数据集的核心内容为原始序列读长（Raw sequence reads），即转录组测序产生的未经加工或仅经过初步碱基识别处理的序列数据。主题标签明确标注为“Raw sequence reads”，说明数据以测序读长形式提供，而非经过比对、定量或差异表达分析后的汇总结果。数据对应的生物学对象为滑膜成纤维细胞，实验条件涉及 ACOX1 过表达。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、读长长度、测序深度、是否包含对照组等具体技术细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的官方网站。数据以 BioProject 记录形式发布，项目编号为 PRJNA1536700，源站标题为“ID 1536700 - BioProject - NCBI”。BioProject 记录本身并不直接存储所有原始数据文件，而是提供指向该项目所产生各类数据的链接入口。关于样本采集地点、采集时间、供体信息、伦理审批信息以及具体的实验操作流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关的研究场景。由于数据为原始序列读长，用户可将其用于自主的序列比对、转录本组装、表达定量以及差异表达分析等下游处理流程。具体而言，该数据可用于探索 ACOX1 过表达对滑膜成纤维细胞基因表达谱的影响，也可作为滑膜成纤维细胞转录组研究的参考数据之一。此外，对代谢相关基因在关节滑膜细胞中功能感兴趣的研究者，也可能将该数据集纳入二次分析或整合分析。需要注意的是，适用场景的确定应结合用户自身的研究目的和数据处理能力，源站未提供针对该数据集的具体应用建议。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库检索项目编号 PRJNA1536700 或标题关键词找到该记录。BioProject 记录页面提供指向该项目所产生数据的链接，用户可据此定位原始序列读长文件。由于数据格式为原始序列读长，通常需要借助生物信息学工具进行质量控制、接头去除、比对或组装等预处理步骤，然后才能开展表达分析。具体使用方式取决于用户所采用的分析流程和参考基因组版本。关于数据下载的具体步骤、推荐工具或分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以原始序列读长形式提供，意味着数据尚未经过完整的生物信息学处理，其质量取决于原始测序过程。用户在使用前应自行进行质量控制评估。此外，该数据集仅包含 ACOX1 过表达条件下滑膜成纤维细胞的转录组数据，关于是否包含对照样本、重复样本数量、批次效应等信息，源站未提供。因此，用户在开展差异表达分析或因果推断时，需谨慎考虑实验设计的完整性。该数据集的分类为“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”，但这一分类是否与数据内容直接对应，源站未提供进一步说明。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 PRJNA1536700。关于该数据集的引用方式、使用许可、数据共享政策以及是否存在使用限制等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应遵循 NCBI 数据库的一般使用条款，并建议查阅 BioProject 记录页面以获取最新的引用和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1536700
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该RNA-seq数据集旨在研究滑膜成纤维细胞中ACOX1过表达诱导的转录变化。滑膜成纤维细胞分为两个实验组：对照组和ACOX1过表达组。每组包含六个生物学重复。从细胞中提取总RNA并进行转录组测序。所得RNA-seq数据用于表征ACOX1相关的转录变化，特别侧重于炎症、代谢和细胞外基质相关通路。这些数据为研究ACOX1在调节滑膜成纤维细胞功能表型中的作用提供了转录组学证据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
