PRJNA1470948:艾灸对DSS诱导溃疡性结肠炎保护作用的多组学分析
该数据集来自 NCBI,围绕艾灸对 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎的保护作用及分子机制展开。研究通过转录组测序刻画肠道炎症、上皮屏障功能障碍及趋化因子介导的免疫信号相关宿主基因表达变化,并整合肠道菌群与代谢组等多组学分析,识别微生物失调、代谢紊乱与炎症通路之间的相互作用

基本信息
资源简介
PRJNA1470948:艾灸对DSS诱导溃疡性结肠炎保护作用的多组学分析
PRJNA1470948 是一个围绕艾灸干预溃疡性结肠炎机制的多组学研究数据集,全称为“Multi-omics analysis of moxibustion-mediated protection against DSS-induced ulcerative colitis”。该数据集来自 NCBI,主题标签为原始测序读段(Raw sequence reads),在本站被归类于“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”方向。研究以 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型为基础,考察艾灸的保护效应及其潜在分子机制,并通过转录组测序刻画与肠道炎症、上皮屏障功能障碍以及趋化因子介导的免疫信号相关的宿主基因表达变化。同时,研究还整合了肠道菌群与代谢组等多组学分析,用以识别微生物失调、代谢紊乱与炎症通路之间的相互作用,为理解艾灸的免疫调节机制以及 CCL2/CCL4 信号在溃疡性结肠炎中的作用提供了数据资源。
【数据集背景】
溃疡性结肠炎是一种以肠道炎症、上皮屏障损伤和免疫信号异常为特征的疾病。该数据集所对应的研究聚焦于艾灸在 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型中的保护作用及其分子机制。研究关注的核心问题包括:艾灸干预后宿主基因表达如何变化,肠道炎症、上皮屏障功能障碍以及趋化因子介导的免疫信号在其中扮演何种角色,以及肠道菌群和代谢组层面的改变如何与炎症通路发生关联。通过多组学整合,该研究试图从转录组、肠道菌群和代谢组等多个层面理解艾灸的免疫调节作用,并特别关注 CCL2/CCL4 信号在溃疡性结肠炎中的角色。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其包含原始测序读段。研究开展了转录组测序,用于表征与肠道炎症、上皮屏障功能障碍和趋化因子介导的免疫信号相关的宿主基因表达变化。此外,研究还进行了整合多组学分析,涵盖肠道菌群和代谢组谱分析,以识别微生物失调、代谢扰动与炎症通路之间的相互作用。数据集为理解艾灸的免疫调节机制以及 CCL2/CCL4 信号在溃疡性结肠炎中的作用提供了资源。除上述内容外,关于样本数量、测序平台、读长、数据量、具体菌群分类或代谢物名称等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。研究基于 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型,对艾灸干预后的样本进行转录组测序,并开展肠道菌群与代谢组等多组学分析。数据集英文名称中包含了项目编号 PRJNA1470948。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、动物品系、饲养条件、艾灸操作细节以及测序建库方法等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究艾灸对 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎的保护作用及其分子机制。具体而言,可用于分析与肠道炎症、上皮屏障功能障碍和趋化因子介导的免疫信号相关的宿主基因表达变化;也可用于整合肠道菌群与代谢组数据,探索微生物失调、代谢紊乱与炎症通路之间的相互作用。此外,该数据集有助于理解艾灸的免疫调节机制以及 CCL2/CCL4 信号在溃疡性结肠炎中的作用。对于关注多组学整合分析、溃疡性结肠炎模型以及艾灸干预机制的研究者,该数据集具有参考价值。
【使用方法】
该数据集以原始测序读段的形式提供,可通过 NCBI 来源站获取。使用者可根据研究目的对转录组测序数据进行基因表达分析,并结合肠道菌群与代谢组数据进行多组学整合分析。由于数据集涉及多组学层面,使用时可围绕肠道炎症、上皮屏障功能障碍、趋化因子介导的免疫信号、微生物失调、代谢扰动和炎症通路等主题展开分析。关于具体的下载方式、数据格式、分析流程、软件工具和参数设置等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI,主题标签为原始测序读段,研究基于 DSS 诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型,并整合了转录组、肠道菌群和代谢组等多组学数据。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、重复数、批次效应、缺失值情况以及统计功效等信息,源站未提供。使用者在解释结果时,应结合研究设计和小鼠模型的特点,注意物种差异和实验条件对结论外推的限制。关于该数据集的具体局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA1470948: Multi-omics analysis of moxibustion-mediated protection against DSS-induced ulcerative colitis。关于引用方式、许可协议、使用条款以及数据共享政策等信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470948
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了艾灸在葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠溃疡性结肠炎(UC)中的保护作用及其潜在分子机制。通过转录组测序表征了与肠道炎症、上皮屏障功能障碍及趋化因子介导的免疫信号传导相关的宿主基因表达变化。整合了多组学分析,包括肠道菌群和代谢组学分析,以识别微生物失调、代谢紊乱和炎症通路之间的相互作用。该数据集为理解艾灸的免疫调节机制以及CCL2/CCL4信号在UC中的作用提供了宝贵的资源。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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