PRJNA1470913:印度中部Baiga部落肠道微生物组组成与功能潜力
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1470913),主题为印度中部特别脆弱部落群体 Baiga 部落的肠道微生物组组成与功能潜力,数据主题标签为 Raw sequence reads

基本信息
资源简介
PRJNA1470913:印度中部Baiga部落肠道微生物组组成与功能潜力
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1470913,英文名称为“Gut Microbiome Composition and Functional Potential of the Baiga Tribe: Insights from an Indigenous Particularly Vulnerable Tribal Group in Central India”。从名称可以看出,该项目的关注对象是印度中部一个被认定为“特别脆弱部落群体”的 Baiga 部落,研究内容聚焦于其肠道微生物组的组成与功能潜力。数据集在 NCBI 的 BioProject 体系下登记,主题标签为“Raw sequence reads”,表明其核心数据形式为原始测序读长。本站将其归类于“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”方向,提示该数据可能与宿主代谢、营养状态及微生物功能相关的研究场景存在关联。整体而言,这是一个来源于公共生物数据平台、以部落人群肠道微生物组为研究对象的原始测序数据集合。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级数据组织方式,用于汇集围绕同一项研究计划所产生的多种类型生物数据。按照 NCBI 的说明,一个 BioProject 记录通常源自单一机构或一个联合体,并为用户提供统一入口,以便查找该项目所生成的不同数据类型。该数据集所对应的项目,正是以印度中部 Baiga 部落这一原住民特别脆弱部落群体为研究对象,围绕其肠道微生物组的组成和功能潜力展开。项目名称同时点明了人群的特殊性与研究主题的微生物组学属性,说明其数据产生背景与人群健康、营养代谢及微生物生态等方向有关。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,即原始测序读长。这意味着数据内容以测序仪直接产出的序列读长为主,通常可用于后续的微生物组组成分析、物种注释、功能潜力预测等生物信息学处理。项目名称中“Gut Microbiome Composition and Functional Potential”表明,数据所支撑的研究目标包括肠道微生物组的组成刻画以及功能潜力的评估。除原始测序读长这一标签外,源站未提供更细的数据类型、样本数量、测序平台或数据量信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject,源站标题为“ID 1470913 - BioProject - NCBI”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。项目研究对象为印度中部的 Baiga 部落,该群体被描述为原住民特别脆弱部落群体。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批、受试者数量及纳入排除标准等信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其原始测序读长的数据属性以及肠道微生物组组成与功能潜力的研究主题,该数据集可适用于微生物组组成分析、功能潜力预测、人群间微生物组比较等研究场景。本站分类将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”,提示其可能用于与营养、代谢相关的微生物组研究。但具体适用场景需结合项目原始设计判断,源站未提供明确的适用说明。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录形式提供,用户可通过 NCBI BioProject 入口查找该项目所链接的多种数据类型。由于主题标签为原始测序读长,常规使用方式包括下载原始读长后进行质量控制、序列比对、物种分类注释及功能潜力分析等。关于具体的下载路径、数据格式、分析流程或配套工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共生物数据平台登记的项目级数据集合。其主题标签为原始测序读长,意味着数据未经汇总或高级加工,使用时需自行完成质控与分析。关于数据质量评分、测序深度、覆盖度、样本代表性及潜在偏差等信息,源站未提供。此外,该数据集聚焦于特定部落群体,外推至其他人群时需谨慎,但源站未就此给出明确限制说明。
【引用与许可】
该数据集登记于 NCBI BioProject,编号为 1470913。关于该项目的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470913
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
一项关于肠道微生物群的观察性横断面研究:土著Baiga部落与印度城市人群的比较。从传统的、以自给自足为基础的生活方式向现代化城市环境的转变,是全球人类肠道微生物组多样性下降的主要驱动因素(“消失的微生物群假说”)。该数据集包含源自印度中央邦50名成年志愿者粪便(大便)样本的原始宏基因组测序数据,旨在评估城市化、饮食和生活方式对人类肠道生态的影响。研究队列由两个不同人群组成:25名来自土著Baiga部落的个体(该部落是位于Khatiya Narangi的一个特别脆弱部落群体),他们保持着传统的、高纤维的觅食和农耕生活方式;以及25名来自地理上共享的、高度现代化的博帕尔城市人群的个体。这项横断面研究的主要目标是识别由市场整合、精细化饮食和环境暴露所驱动的肠道微生物组在结构、分类学和功能上的变化。
这些序列为了解人类肠道生态系统的祖先状态提供了关键见解,捕捉到了独特的纤维降解微生物网络,并记录了与城市化和代谢疾病风险相关的深刻生态重构。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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