植物乳杆菌J26补充对代谢综合征成人肠道菌群的影响
该数据集来自 NCBI,包含一项为期 12 周的随机、双盲、安慰剂对照试验中采集的粪便样本 16S rRNA 基因扩增子测序数据,用于评估 Lactiplantibacillus plantarum J26 补充对代谢综合征成人肠道菌群的影响

基本信息
资源简介
植物乳杆菌J26补充对代谢综合征成人肠道菌群的影响
PRJNA1462753 数据集收录于 NCBI,来源于一项为期 12 周的随机、双盲、安慰剂对照试验,旨在评估 Lactiplantibacillus plantarum J26 补充对代谢综合征成人肠道菌群的影响。该数据集包含试验中采集的粪便样本 16S rRNA 基因扩增子测序数据,参与者分别接受 J26 补充或安慰剂,并在基线及干预后采集粪便样本。数据用于刻画肠道菌群组成与多样性,并评估干预相关的微生物变化。本站将其归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 其他类别,主题标签为原始序列读长(Raw sequence reads)。
【数据集背景】
该数据集对应的研究聚焦于代谢综合征成人人群,采用随机、双盲、安慰剂对照的临床试验设计,干预周期为 12 周。研究目的是评估 Lactiplantibacillus plantarum J26 补充对肠道菌群的影响。代谢综合征是一组与内分泌、营养和代谢相关的临床症候群,肠道菌群被认为是影响宿主代谢状态的重要因素之一。该试验通过设置安慰剂对照和双盲设计,试图减少偏倚,从而更可靠地观察 J26 补充与肠道菌群变化之间的关联。数据集即产生于这一试验框架之下,用于支持对肠道菌群组成、多样性及干预相关变化的分析。
【数据内容】
该数据集包含 16S rRNA 基因扩增子测序数据,样本类型为粪便样本。测序数据来自一项 12 周随机、双盲、安慰剂对照试验,参与者为代谢综合征成人。参与者被分为 J26 补充组和安慰剂组,粪便样本在基线以及干预结束后采集。数据可用于表征肠道菌群组成和多样性,并评估与干预相关的微生物变化。主题标签为原始序列读长,表明数据以原始测序读长形式提供。除上述信息外,源站未提供关于样本量、测序平台、目标区域、数据文件数量或具体微生物分类结果的更多细节。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集自一项 12 周随机、双盲、安慰剂对照试验中的代谢综合征成人参与者。试验中,参与者接受 Lactiplantibacillus plantarum J26 补充或安慰剂,粪便样本在基线及干预后采集。该数据集即为这些粪便样本的 16S rRNA 基因扩增子测序数据。关于样本采集的具体地点、伦理审批信息、参与者招募标准及知情同意流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肠道菌群相关研究,尤其是针对代谢综合征人群的微生物组成与多样性分析。具体而言,可用于比较 J26 补充组与安慰剂组在基线及干预后的粪便菌群差异,评估干预相关的微生物变化,或作为代谢综合征与肠道菌群关系研究的参考数据。由于数据为 16S rRNA 基因扩增子测序的原始序列读长,适合进行微生物群落结构、多样性及分类组成等分析。也可用于方法学比较、可重复性验证或与其他肠道菌群数据集的整合分析。但需注意,该数据集仅覆盖特定试验条件下的人群和样本,外推到其他人群或干预场景时应谨慎。
【使用方法】
使用该数据集时,通常需要先获取原始序列读长,然后进行质量控制、去噪或聚类、分类学注释及多样性分析等标准 16S rRNA 扩增子数据处理流程。分析时可依据试验设计,将样本按干预组别和采集时间点进行分组比较,以评估 J26 补充对肠道菌群组成和多样性的影响。由于数据来自随机、双盲、安慰剂对照试验,分析中可考虑配对或重复测量结构,以反映基线与干预后样本的对应关系。具体分析软件、参数和流程需根据研究目的选择。源站未提供关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤或推荐分析管道的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集来自随机、双盲、安慰剂对照试验,设计上有助于控制偏倚。数据为 16S rRNA 基因扩增子测序的原始序列读长,可支持菌群组成和多样性分析。然而,源站未提供样本量、测序深度、测序平台、目标区域、数据质量评估指标及潜在批次效应等信息,因此无法对数据质量进行具体判断。此外,16S rRNA 扩增子测序通常只能提供分类学层面的信息,难以直接推断功能或代谢通路。该数据集仅涉及代谢综合征成人,干预为 Lactiplantibacillus plantarum J26 补充,结果外推至其他人群、其他菌株或其他干预条件时需谨慎。源站未提供关于缺失数据、污染控制或统计功效的说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制及是否允许再分发,源站未提供。使用者在利用该数据集时,应自行查阅 NCBI 相关页面以获取准确的引用要求和许可信息。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1462753
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目包含来自粪便样本的16S rRNA基因扩增子测序数据,这些样本采集自一项为期12周的随机、双盲、安慰剂对照试验,该试验旨在评估植物乳杆菌J26补充剂对代谢综合征成人的影响。参与者接受J26补充剂或安慰剂,并在基线和干预后收集粪便样本。该数据集旨在表征肠道微生物群组成和多样性,评估与干预相关的微生物变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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