甲状腺眼病患者结膜囊、深鼻、粪便及阴性对照样本的16S rRNA基因扩增子测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1433797

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该BioProject包含来自85份样本的16S核糖体RNA基因扩增子测序数据，这些样本与确诊为甲状腺眼病（TED）的患者相关。数据集包括25份结膜囊拭子、25份深部鼻拭子、25份粪便样本和10份无菌水阴性对照。纳入无菌水对照是为了监测样本处理和测序过程中可能存在的背景污染。本研究旨在表征TED患者眼表、上气道和肠道相关样本类型中的微生物群落谱。该数据集为研究TED中部位特异性微生物群模式以及微生物群落与疾病相关特征之间的潜在关联提供了资源。该BioProject重点关注结膜囊拭子、深部鼻拭子、粪便样本和无菌水阴性对照。来自眼眶脂肪组织样本的相应16S核糖体RNA基因扩增子测序数据可在BioProject PRJNA1433791下获取。所有样本均采用标准化程序采集和处理，以确保数据质量。

来自16S核糖体RNA基因扩增子文库的测序读段已存入该BioProject下的Sequence Read Archive。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。