甲状腺眼病患者眶脂肪组织16S rRNA基因扩增子测序
该数据集来自 NCBI BioProject PRJNA1433791,包含25名甲状腺眼病(TED)患者眶脂肪组织样本的16S rRNA基因扩增子测序数据,用于刻画与眶脂肪组织相关的微生物群落组成

基本信息
资源简介
甲状腺眼病患者眶脂肪组织16S rRNA基因扩增子测序
该数据集来自 NCBI BioProject PRJNA1433791,包含25名甲状腺眼病(TED)患者眶脂肪组织样本的16S rRNA基因扩增子测序数据,用于刻画与眶脂肪组织相关的微生物群落组成。数据以原始测序读长形式存放于Sequence Read Archive。样本采集与处理采用标准化流程以保证数据质量。该数据可用于眶脂肪组织微生物群落分类与组成分析,并可与同一研究中其他样本类型(结膜囊拭子、深鼻拭子、粪便及无菌水阴性对照,见PRJNA1433797)的数据联合比较(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该BioProject包含从25名确诊甲状腺眼病(TED)患者采集的眶脂肪组织样本中生成的16S核糖体RNA基因扩增子测序数据。该研究旨在刻画与TED眶脂肪组织相关的微生物群落组成。本数据集专门聚焦于眶脂肪组织样本。来自其他样本类型(包括结膜囊拭子、深鼻拭子、粪便样本和无菌水阴性对照)的额外16S核糖体RNA基因扩增子测序数据可在BioProject PRJNA1433797下获取。所有样本均采用标准化流程采集和处理,以确保数据质量。16S核糖体RNA基因扩增子文库的测序读长已存入该BioProject下的Sequence Read Archive。
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1433791
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1433791
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该BioProject包含来自25名甲状腺眼病(TED)患者眼眶脂肪组织样本的16S核糖体RNA基因扩增子测序数据。该研究旨在表征与TED眼眶脂肪组织相关的微生物群落组成。本数据集专门针对眼眶脂肪组织样本。其他样本类型(包括结膜囊拭子、深部鼻拭子、粪便样本和无菌水阴性对照)的16S核糖体RNA基因扩增子测序数据可在BioProject PRJNA1433797下获取。所有样本均采用标准化流程采集和处理,以确保数据质量。16S核糖体RNA基因扩增子文库的测序读长已存入本BioProject下的序列读取存档。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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