PRJNA1396794:温和热处理激活PI3K/Akt信号并抑制颗粒细胞凋亡以改善多囊卵巢综合征

该数据集来自 NCBI,围绕多囊卵巢综合征(PCOS)与胰岛素抵抗相关的分子程序,并评估温和热处理(MHT)的作用。样本取自脱氢表雄酮诱导的 PCOS 大鼠模型(含或不含 MHT)及匹配对照的卵巢组织,通过 bulk RNA-seq 获取转录组范围的变化,识别与胰岛素和葡萄糖代谢、炎症及 PI3K/

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时间序列分类Raw sequence reads
PRJNA1396794: Mild heat treatment activates PI3K/Akt signaling and inhibits apoptosis in granulosa cells for improving polycystic ovary syndrome

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1396794:温和热处理激活PI3K/Akt信号并抑制颗粒细胞凋亡以改善多囊卵巢综合征

该数据集来自 NCBI,围绕多囊卵巢综合征(PCOS)与胰岛素抵抗相关的分子程序,并评估温和热处理(MHT)的作用。样本取自脱氢表雄酮诱导的 PCOS 大鼠模型(含或不含 MHT)及匹配对照的卵巢组织,通过 bulk RNA-seq 获取转录组范围的变化,识别与胰岛素和葡萄糖代谢、炎症及 PI3K/Akt 信号通路相关的改变。数据集提供各实验组间的基因表达谱,可用于比较分析,并支持下游通路富集与机制解释。其主题标签为原始序列读段(Raw sequence reads),本站分类归入内分泌、营养和代谢疾病下的其他类别。

【数据集背景】

多囊卵巢综合征(PCOS)是一种与胰岛素抵抗密切相关的内分泌代谢紊乱。本项目旨在研究与 PCOS 及胰岛素抵抗相关的分子程序,并评估温和热处理(MHT)对该疾病模型的影响。研究聚焦于卵巢组织在 PCOS 状态下的转录组变化,以及 MHT 干预后这些变化是否受到调节,从而为理解 PCOS 的分子机制和潜在干预手段提供数据基础。

【数据内容】

该数据集的核心内容是针对卵巢组织进行的 bulk RNA-seq 所产生的原始序列读段(Raw sequence reads)。通过转录组范围的测序,数据集提供了不同实验组之间的基因表达谱,可用于比较分析。所识别的通路涉及胰岛素和葡萄糖代谢、炎症以及 PI3K/Akt 信号通路,这些通路在 PCOS 模型中发生改变,并在 MHT 之后受到调节。数据集支持下游的通路富集分析和机制解释。

【采集与来源】

样本采集自脱氢表雄酮(DHEA)诱导的 PCOS 大鼠模型,包括接受 MHT 和不接受 MHT 的组别,并设有匹配的对照组。卵巢组织被收集后用于 bulk RNA-seq 测序。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名称为“PRJNA1396794: Mild heat treatment activates PI3K/Akt signaling and inhibits apoptosis in granulosa cells for improving polycystic ovary syndrome”。

【适用场景】

该数据集适用于对 PCOS 及胰岛素抵抗相关分子程序进行对比分析的研究。具体而言,可用于比较 PCOS 模型组、MHT 干预组与匹配对照组之间的基因表达差异,识别与胰岛素和葡萄糖代谢、炎症及 PI3K/Akt 信号通路相关的改变。此外,数据集支持下游通路富集分析和机制解释,适合用于探索 MHT 对 PCOS 卵巢组织转录组的影响,以及颗粒细胞中 PI3K/Akt 信号与凋亡相关机制的后续研究。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

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【引用与许可】

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1396794

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目研究与多囊卵巢综合征(PCOS)及胰岛素抵抗相关的分子程序,并评估温和热处理(MHT)的效果。从脱氢表雄酮诱导的PCOS大鼠模型中收集卵巢组织,分别在有或无MHT处理的情况下,并设置匹配的对照组。采用bulk RNA-seq进行转录组范围的变化分析,并识别在PCOS模型中发生改变且经MHT调节的、与胰岛素和葡萄糖代谢、炎症及PI3K/Akt信号通路相关的通路。所得数据集提供了各实验组间比较分析的基因表达谱,并支持下游通路富集与机制解读。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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