PCOS大鼠肠道菌群16S rRNA基因测序(绞股蓝皂苷干预)
本数据集为多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型在绞股蓝皂苷干预后的肠道菌群16S rRNA基因测序原始序列数据。研究建立PCOS大鼠模型并分为正常对照组、PCOS模型组和绞股蓝皂苷治疗的PCOS组,每组采集4只大鼠粪便样本,共12份

基本信息
资源简介
PCOS大鼠肠道菌群16S rRNA基因测序(绞股蓝皂苷干预)
本数据集为多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型在绞股蓝皂苷干预后的肠道菌群16S rRNA基因测序原始序列数据。研究建立PCOS大鼠模型并分为正常对照组、PCOS模型组和绞股蓝皂苷治疗的PCOS组,每组采集4只大鼠粪便样本,共12份。采用高通量16S rRNA基因扩增子测序(V3-V4区)对肠道微生物群落进行图谱分析,可用于比较各组间菌群结构差异,探究绞股蓝皂苷是否通过调节肠道菌群改善PCOS(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究探讨绞股蓝皂苷对多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型肠道菌群结构的影响。PCOS是一种常见的内分泌和代谢紊乱,新出现的证据表明其发病机制与肠道菌群失调之间可能存在联系。据报道,绞股蓝皂苷具有多种药理特性,包括抗炎、抗氧化和代谢调节作用。然而,它们是否通过调节肠道菌群来改善PCOS仍不清楚。建立PCOS大鼠模型并分为三组:正常对照(Control)、PCOS模型(PCOS-Model)和绞股蓝皂苷治疗的PCOS(PCOS-Gyp)。每组采集4只大鼠的粪便样本(共12份)。使用高通量16S rRNA基因扩增子测序(V3-V4区)对肠道微生物群落进行分析,以系统比较其群落
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1374190
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数据说明
本研究探讨了绞股蓝皂苷对多囊卵巢综合征(PCOS)大鼠模型肠道菌群结构的影响。PCOS是一种常见的内分泌和代谢紊乱,新出现的证据表明其发病机制与肠道菌群失调之间存在潜在联系。据报道,绞股蓝皂苷具有多种药理特性,包括抗炎、抗氧化和代谢调节作用。然而,其是否通过调节肠道菌群来改善PCOS仍不清楚。建立PCOS大鼠模型并分为三组:正常对照组(Control)、PCOS模型组(PCOS-Model)和绞股蓝皂苷治疗的PCOS组(PCOS-Gyp)。每组采集4只大鼠的粪便样本(共12只)。
采用高通量16S rRNA基因扩增子测序(V3-V4区)对肠道微生物群落进行分析,以系统比较各组之间的组成、多样性和结构。本项目旨在:1)确定PCOS诱导是否较对照组显著改变肠道微生物群;2)评估绞股蓝皂苷干预是否逆转PCOS相关的微生物失调;3)识别与治疗反应相关的关键微生物分类群或功能模块。本研究将提供数据,以阐明绞股蓝皂苷对PCOS疗效的潜在微生物学机制,并为新的微生态治疗策略提供依据。所提交的数据集包含全部12个样本的原始测序文件(FASTQ格式)和样本元数据,适用于下游生物信息学分析,如微生物群落比较、多样性评估和差异丰度分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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