中国西北地区川崎病患儿肠道微生物组特征数据集

该数据集来自NCBI,包含中国西北地区川崎病(KD)患儿的肠道微生物组特征及相关代谢组学数据。研究旨在刻画该地区儿童KD的肠道微生物组成、代谢谱及其潜在关联,提供整合性基线数据,以探索肠道菌群、代谢物与KD发病机制之间的相互作用,并识别可用于临床研究的潜在微生物与代谢标志物

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1370643: Gut Microbiome Features of Children with Kawasaki Disease in Northwest China

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

中国西北地区川崎病患儿肠道微生物组特征数据集

PRJNA1370643 数据集收录了中国西北地区川崎病(KD)患儿的肠道微生物组特征及相关代谢组学数据。该数据集来自 NCBI,主题标签为原始序列读长(Raw sequence reads),本站将其归类于内分泌、营养和代谢疾病下的其他类别。研究的核心目标是刻画该地区儿童川崎病患者的肠道微生物组成、代谢谱以及两者之间的潜在关联,从而提供一套整合性的基线数据,用于探索肠道菌群、代谢物与川崎病发病机制之间的相互作用,并识别可能服务于临床研究的微生物与代谢标志物。整体而言,该数据集将微生物组与代谢组两个层面的信息汇聚于同一儿科疾病背景之下,为相关基础与临床研究提供了可参考的数据基础。

【数据集背景】

川崎病是一种主要影响儿童的疾病,其发病机制涉及多方面因素。该数据集聚焦于中国西北地区这一特定地理范围内的川崎病患儿,试图从肠道微生物组与代谢组的角度切入,补充该区域儿科川崎病研究的基线资料。源站描述指出,研究的主要目的在于刻画该地区儿童川崎病的肠道微生物组成、代谢谱及其潜在关联,并在此基础上探索肠道菌群、代谢物与川崎病发病机制之间的相互作用,同时识别潜在的微生物与代谢标志物以供临床研究使用。这一背景决定了数据集兼具微生物组学与代谢组学的双重属性,并以儿科川崎病为核心研究对象。

【数据内容】

该数据集包含中国西北地区川崎病患儿的肠道微生物组特征数据以及相关的代谢组学数据。其主题标签为原始序列读长,表明数据中涉及测序产生的原始序列读长信息。源站描述同时强调,数据集旨在提供整合性的基线数据,即把肠道微生物组成与代谢谱两方面的信息结合起来,用于考察二者之间的潜在关联。数据内容围绕微生物组与代谢组两个层面组织,服务于对儿童川崎病肠道微生态特征的刻画。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),英文名称为 PRJNA1370643: Gut Microbiome Features of Children with Kawasaki Disease in Northwest China。研究对象为中国西北地区的川崎病患儿。除上述来源与研究对象信息外,源站未提供更详细的采样地点、采样时间、样本数量及采集流程等信息。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于以下研究方向:刻画中国西北地区儿童川崎病的肠道微生物组成与代谢谱;分析肠道微生物组与代谢组数据之间的潜在关联;探索肠道菌群、代谢物与川崎病发病机制之间的相互作用;以及识别可用于临床研究的潜在微生物与代谢标志物。此外,作为一套整合性基线数据,它也可为后续在该地理区域内开展的儿科川崎病相关研究提供参照。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。数据集主题涉及原始序列读长,相关分析通常需依托微生物组与代谢组学的通用处理流程,但该数据集的具体使用方式、分析步骤与配套工具信息源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本规模、数据完整性或技术限制的说明。该数据集聚焦于中国西北地区的川崎病患儿,其适用范围受地域与人群限定;除此之外的其他限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1370643

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含中国西北地区川崎病(KD)患儿的肠道微生物组特征及相关代谢组学数据。主要研究目的是表征该地理区域内儿童KD的肠道微生物组成、代谢谱及其潜在关联,提供整合的基线数据,以探索肠道微生物群、代谢物与KD发病机制之间的相互作用,并为临床研究识别潜在的微生物和代谢标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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