NUCB2 Nesfatin1通过mTORC1依赖性激活SREBP2-HMGCR胆固醇生物合成轴驱动角质形成细胞再上皮化
该数据集为RNA-seq原始测序数据,来自转导对照shRNA或NUCB2靶向shRNA的人HaCaT角质形成细胞(每组n=3),用于研究NUCB2敲低后的转录组变化

基本信息
资源简介
NUCB2 Nesfatin1通过mTORC1依赖性激活SREBP2-HMGCR胆固醇生物合成轴驱动角质形成细胞再上皮化
该数据集为RNA-seq原始测序数据,来自转导对照shRNA或NUCB2靶向shRNA的人HaCaT角质形成细胞(每组n=3),用于研究NUCB2敲低后的转录组变化。数据经双端测序、比对人类参考基因组并开展差异表达与通路富集分析,覆盖胆固醇生物合成、固醇代谢、上皮稳态及mTOR相关信号通路,可用于评估NUCB2缺失对表皮生物学的影响,并为NUCB2/Nesfatin-1在角质形成细胞功能、再上皮化及皮肤伤口修复中的机制研究提供转录组资源(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目研究NUCB2敲低在人角质形成细胞中的转录后果。对转导对照shRNA或NUCB2靶向shRNA的HaCaT细胞(每组n=3)进行RNA-seq,以表征受NUCB2调控的分子通路。生成了高质量双端测序数据,比对到人类参考基因组,并分析差异表达和通路富集。该数据集可系统评估NUCB2缺失如何影响表皮生物学,包括胆固醇生物合成、固醇代谢过程、上皮稳态和mTOR相关信号通路。这些数据提供了转录组资源,支持NUCB2/Nesfatin-1在角质形成细胞功能、再上皮化和皮肤伤口修复中的机制研究。
【主题与分类】
主题标签:Raw sequence reads。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1367328
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- OpenDataLab:
数据说明
本项目研究NUCB2敲低对人角质形成细胞转录的影响。对转导对照shRNA或靶向NUCB2的shRNA的HaCaT细胞(每组n = 3)进行RNA-seq,以表征受NUCB2调控的分子通路。生成了高质量的配对末端测序数据,将其比对至人类参考基因组,并分析差异表达与通路富集。该数据集可系统评估NUCB2缺失如何影响表皮生物学,包括胆固醇生物合成、甾醇代谢过程、上皮稳态及mTOR相关信号通路。这些数据提供了转录组资源,支持对NUCB2/Nesfatin-1在角质形成细胞功能、再上皮化及皮肤伤口修复中的机制研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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